胰腺癌俗稱「癌中之王」。
近些年,死於胰腺癌的世界級名人包括:世界男高音帕瓦羅蒂、諾獎得主斯塔曼……
胰腺癌發現晚,治療手段有限,療效差,致死率高,一年存活率僅為25% 1 。
胰腺腫瘤分為兩種。最常見的是起源於胰腺導管的胰腺腺癌(PDAC),即通常說的「胰腺癌」。另一種是起源於胰腺有分泌激素功能的細胞,即胰腺內分泌腫瘤。
胰腺的位置深,胰腺癌早期症狀不明顯、發病原因不明確……這些都制約著胰腺癌的早發現。
血液中的糖類抗原19-9(CA19-9),是當前唯一被FDA批准的胰腺癌標誌物。然而, CA19-9水平與其它多種症狀關聯(如膽道阻塞),對胰腺癌的篩查特異性低(0.75,95% CI 0.72-0.86) 2 ,亟需更高效的篩查方法。
近日,發表在 Gut 上的一個研究發現 糞便微生物可用於胰腺癌篩查,單獨使用時準確性達到0.84(AUROC值,一種模型評估指標);當與血液CA19-9聯合使用時,準確性提升至0.943 。該研究由學界大咖Peer Bork領導的德國和西班牙科學家共同完成。
既往研究已多次揭示微生物與胰腺癌的關聯。胰腺本身被特定微生物定植,包括口腔和腸道的常見細菌 4, 5 。小鼠模型研究發現,腸道來源細菌能促進胰腺導管癌的形成 6 。另有研究發現人口腔和腸道的特定微生物與胰腺癌發病風險相關 7 。
受這些研究啟發, Bork團隊基於136位法國受試者(57位胰腺癌患者,50位對照,29位慢性胰腺炎患者),以及76位德國受試者(44位胰腺癌患者,32位對照),採集糞便、唾液、腫瘤和癌旁組織樣品,使用DNA測序技術,系統性地挖掘糞便微生物和唾液微生物對胰腺癌的預測效果(圖1)。
圖1:研究樣本和數據組成。rRNA:ribosomal RNA
該研究首要問題是確認糞便微生物組成與胰腺癌的關聯。在排除年齡、性別等因素的影響後,糞便微生物組成與胰腺癌顯著相關(R 2 =0.01,P=0.5)。單因素檢驗發現,9個細菌物種與胰腺癌關聯(多重檢驗校正P<0.05)。其中,非典型韋榮氏球菌( Veillonella atypica )、具核梭桿菌( Fusobacterium nucleatum )和廣棲別樣斯卡多維亞菌( Alloscardovia omnicolens )等細菌在胰腺癌組富集。
這27個細菌包括胰腺癌組富集的細菌:史密斯產甲烷短桿菌( Methanobrevibacter smithii )、 廣棲別樣斯卡多維亞菌、 非典型韋榮氏球菌和芬氏擬桿菌( Bacteroides finegoldii )等;也包括胰腺癌組中缺少的細菌:普氏棲糞桿菌( Faecalibacterium prausnitzii )、糞居擬桿菌( Bacteroides coprocola )、雙歧雙歧桿菌( Bifidobacterium bifidum )和羅姆布茨菌( Romboutsia timonensis )。
圖2:模型1中挑選到的27種糞便微生物在訓練集樣本中的分布。PDAC:胰腺導管癌,俗稱胰腺癌。
在胰腺癌組缺乏的細菌通常與多種非癌症病變有關聯 8 ,它們並不是胰腺癌特有的標誌細菌,並且影響模型對胰腺癌的判別特異性。為此, 研究者用同樣的方法,僅從胰腺癌組富集的細菌中挑選標記物,重新構建了一個分類模型,簡稱模型2(model-2)。
結果顯示,模型2的準確性(AUROC=0.71)比模型1低。這是因為模型2採用了更嚴格的條件,僅納入胰腺癌組富集的細菌,降低了預測的敏感性所致。
糖類抗原CA19-9是腫瘤組織分泌,而糞便微生物可以看做環境因素,在對胰腺癌的預測中,血液CA19-9水平很可能與糞便微生物水平互補。 CA19-9分別與上述兩個模型聯合檢測,兩個模型的準確性都有顯著提升:模型1的AUROC從0.84提升至0.94,模型2的AUROC從0.71提升至0.89。
圖3:模型1(Model 1)和模型2(Model 2)在訓練人群和驗證人群中的預測效果。DE:德國驗證人群;ES:法國訓練人群;TPR:真陽性值。
更為重要的是,胰腺癌的分期不影響上述分類器的預測準確性。在25位胰腺癌早期(T1,T2)患者和32位晚期(T3,T4)患者中,分類器對早晚期胰腺癌的預測效果類似,沒有偏向性。
構建好了分類器模型,接下來就是驗證這些模型的適用性和可推廣性。為此,研究者在兩種不同場景中測試分類器模型。
第一種場景是由76位德國人構成的疾病-對照組(44位胰腺癌患者和32位對照者)。 測試結果顯示,模型1和模型2的準確性與訓練集(法國人)類似:模型1的AUROC為0.83,模型2的AUROC為0.85。與血液CA19-9的聯合檢測時,準確性也都有顯著提升:模型1+CA19-9的AUROC為0.91,模型2+CA19-9的AUROC為0.92。
另外一種場景是5792份糞便宏基因組樣品。這些樣品來自25個已發表研究,涉及18個國家的人群,包括糖尿病、結直腸癌、乳腺癌、肝病和腸炎等多種疾病患者。在10%的假陽性期望值下,模型2比模型1有更低的誤判率。模型2的平均假陽性率不足5%,優於訓練集結果;而模型1平均假陽性率為15%,比訓練集結果差。這說明,模型2在預測胰腺癌時,有更好的特異性。
胰腺是個分泌型器官,其導管與十二指腸連接,形成一個連接通道,方便腸道細菌「跑」到胰腺導管。基於此, 研究者假設在胰腺中也有與胰腺癌關聯的糞便細菌。通過目標基因擴增和螢光原位雜交(圖4),研究者在超過25%的胰腺組織樣品中(腫瘤和非腫瘤)測到至少13個與胰腺癌關聯的糞便細菌。部分細菌在腫瘤組織中富集:乳酸桿菌( Lactobacillus spp )、嗜黏蛋白阿克曼氏菌( Akkermansia muciniphila )和擬桿菌( Bacteroides spp )。這些結果證實了胰腺器官中存在糞便中發現的胰腺癌特異性微生物,與其他研究發現相吻合 9 。
圖4:螢光原位雜交顯微鏡圖。擬桿菌位於腫瘤組織細胞核內(左上);雙歧桿菌位於腫瘤組織細胞核外(右上);乳酸桿菌位於非腫瘤組織細胞核外(左下);鏈球菌位於非腫瘤組織細胞核外(左下);韋榮氏球菌位於腫瘤組織細胞核外(右下)。
綜上,該研究不僅開發了一種基於糞便微生物的胰腺癌無創早篩方法(圖5),還證實了胰腺腫瘤中存在特定的微生物,為胰腺癌的預防、機理研究和治療提供新思路。
圖5:文章圖形摘要
在此之前,糞便微生物已被開發用於多種癌症的檢測,包括結直腸癌 10 和 胃癌 11 。由於糞便微生物不僅可以在身體各部位「流動」 12 ,還可以通過代謝物影響多個器官 13 ,可以推測,糞便微生物在人類與癌症的抗爭中將會持續發光發熱。
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