县级以上公立医院取消编制使用，保留事业单位属性，和高校一样，这是2017年《事业单位分类改革方案》明确规定的原则性政策。2018年3月份开始在陕西省试点，同时也在其他省市不同行政区域内展开试点。高校改革试点是在北京市开展的。
县级以上公立医院和高校都被划分为公益二类事业单位，使用的是差额事业编制。对于在编人员来讲，最愿意听到的改革实施办法，就是“老人老办法，新人新办法”。实际上，这种改革方式，也在其中一些试点地区实施过。具体就是保留原在职人员的编制使用，直至退休、病休、调动等自然减员后，随退随销，由机构编制部门将其使用的编制退一个收回一个，直至最终全部取消。对于改革后新进人员，则全部取消编制使用，实行聘用制管理。包括改革后招考、招聘医务工作者时，公告中明确说明不使用编制。这种做法看似合理，实则根本行不通，即使在试点地区，都已经被叫停。
根据《方案》要求，高校和县级以上公立医院随同事业单位分类改革一起，于2020年底前结果结束。其改革方案和人员转隶方案，对所有参改人员统一一致，体现公正公平原则，并不会实行“老人老办法、新人新办法”的“一院两制”方式。其目的就是为了激活高校和公立医院的活力，激发专业技术人员的竞争意识，促进良性发展，更好地实现公益服务职能的本质作用。如果同一单位两种管理制度，不仅不能体现改革目的，反而会对人事管理造成困难，显然不符合改革要求。
纵观事业单位“全员聘用制”管理改革实践，也许在改革过程中，在起始阶段，为了改革的平稳过渡，和社会的稳定，对老职工在实行合同制管理的时候，会从宽、优待，甚至合同管理会流于形式，但改革的大势难以逆转，最终会走上正规管理渠道，无数次的改革实践，已经证明了这一点。因而对于高校和县级以上公立医院的在职职工来讲，更快更好地接受并适应改革大潮，才是最明智的选择。