在五四运动101周年到来之际，共青团中央公布2019年度“全国优秀共青团员”“全国优秀共青团干部”“全国五四红旗团委(团支部)”等表彰决定，温州医科大学团委荣获“全国五四红旗团委”荣誉称号，是华东地区唯一一所今年获此殊荣的医科大学团委。
温州医科大学团委聚焦共青团主责主业，以干事创业的心态积极做好团工作，为党争取青年人心、汇聚青年力量。温州医科大学团委以深化团学组织改革为根本点，推动新时代共青团组织凝聚力建设。推进青年思政引领工作，涌现全国向上向善好青年、全国优秀共青团干部、全国高校活力团支部、省五四红旗团委等典型。承办全国医药类高校共青团工作联盟年会。以青春战疫为闪光点，在抗击疫情中彰显青春担当。以“大学生科研训练计划”为平台，培育学生创新实践能力。挑战杯最好成绩全国第三，连续四次获优胜杯，3人获中国青少年科技创新奖，1团队获小平科技创新团队，8项作品获“挑战杯”创新创业系列竞赛全国特等奖（金奖）等。
“全国五四红旗团委”是新形势下全面推动共青团改革、推进团的基层组织建设、活跃基层团工作的重要载体，是团中央授予基层团组织的最高荣誉。此次温州医科大学团委荣获“全国五四红旗团委”荣誉称号，是对全体医学类高校共青团工作的肯定，也是对医学类高校各级团组织和广大团员青年的鼓舞，激励各级继续坚持坚持党有号召、团有行动，引领广大团员青年坚定理想信念，不惧风雨、勇挑重担，为推进我省“重要窗口”建设汇聚磅礴青春力量。