杜鹏宇出生于河北保定，7岁时被父亲送去学羽毛球，但因为当时的河北省羽毛球队并不活跃，为了使儿子得到更好的发展，父亲毅然决定将杜鹏宇送到北京学习。在北京市一队学习一年多以后，2003年底杜鹏宇顺利进入国家青年队，并在2006年夺得全国青年羽毛球锦标赛的单打及团体冠军。
杜鹏宇不属于有太多天赋的选手，他给人印象最深刻的就是他在比赛中的拼劲，不管是比分领先还是落后之时，他总是像一只不知疲倦的永动机，满场飞奔，哪怕输掉比赛，也会让对手赢得很痛苦，因此外界都称他为“拼命三郎”，也有球迷称他为“杜三局”，因为比赛时他往往会在不利的情势下坚持到第三局扭转局面。
2014年汤姆斯杯之后，杜鹏宇逐渐淡出了人们的视野，在世锦赛大名单公布之前，杜鹏宇退役的消息也传来。26岁的杜鹏宇在正当打之年突然退役，让很多人不理解，但杜鹏宇却有着自己的苦衷。
退役后他回到老家河北开了一家羽毛球用品店，工作的勤奋程度丝毫不亚于球员时代，相比于其他队友转职做教练，杜鹏宇的退役生活略显平淡：“就是卖羽毛球用品，也去做一些简单的少儿培训，毕竟做别的东西也不懂。”
2016年，杜鹏宇收到了原母队北京队的邀约，为了全运会复出。退役已经3年的他打败了当时世界排名第九的香港选手伍家朗，状态令人称赞。
杜鹏宇的职业生涯时期，林丹、陈金、谌龙等几位主力几乎组成了中国男单最强阵容，这对他来说既是庆幸也是可惜，庆幸的是和伟大的球员生于同一个时代，可惜的是机会也相应的少了很多。