印尼在二战后，摆脱了殖民统治，走上了独立的道路。可印尼和印度有点像，看来真是物以类聚，印尼死活想要继承荷兰在东南亚的全部殖民地，并且对周边一些小岛更是充满了吞并的欲望。就这样，印尼建国没几年就吞并了西巴布亚。紧接着，又吞并了更弱小的东帝汶。
按道理，两起事件也就差了十来年，况且东帝汶面积小，人口少，跟西巴布亚根本不是一个级别。可为什么反而是东帝汶独立呢？
印尼早在独立前，其实就已经开始考虑建国后的疆域问题。特别是苏加诺确实考虑有点长远。苏加诺就认为印尼责无旁贷是荷兰殖民帝国的继承人，而所属荷兰的新几内亚西部理所当然的属于印尼。
果不其然，印尼独立后，开始考虑新几内亚的前途问题。荷兰是坚决反对的，荷兰认为这里跟印尼人种不同，民族不同，西巴布亚又从东印度分离出来，理应独立。而西巴布亚也正是在荷兰支持下，积极地筹备独立，甚至把国旗和国歌都已经选定。
而澳大利亚此时正占据岛屿的东半部分，非常担心印尼在得到西巴布亚后对自己的托管地提出领土要求，况且新几内亚岛距离澳大利亚有点近，澳大利亚非常担心北边的防务问题会加剧，所以和荷兰组成了统一战线。
英美两国还是挺支持印尼的，这主要是因为处于冷战时期，美国担心印尼向苏联靠拢。在美国施压下，荷兰和澳大利亚只好选择接受。但荷兰确实力不从心，又鞭长莫及。毕竟荷兰不可能为了西巴布亚而得罪英美等国，况且荷兰国内老百姓对政府出钱出力，不是太满意。澳大利亚更是英美的小弟，更不会为一点小事讨嫌。
但荷兰还是不死心，要求将巴布亚地区交由联合国监管，并且让巴布亚人民自主决定未来，巴布亚地区于1969年在举行全民公投，公投结果是大多数巴布亚人民同意加入印尼，不过，这一结果并不被部分巴布亚独立人士认可。这一点印尼倒是和当年印度吞并锡金类似，都采取了暴力加“光明正大”的公投。
东帝汶尽管只是弹丸之地，自身实力不足，但还是和西巴布亚有很大区别。
西巴布亚本身就是荷兰殖民地，和荷属东印度也有着说不清的关系，所以很多国家不太愿意多表态，现在仍然被印尼占领的西帝汶恰恰也是荷兰殖民地，但东帝汶并不是，而是葡萄牙殖民地。所以说东帝汶跟印尼没有半毛钱关系，这让印尼根本没有任何理由吞并东帝汶。
而吞并东帝汶的行为完完全全是一个公然挑战二战后的国际秩序，根本不可能得到联合国支持。况且葡萄牙始终坚决反对印尼的侵略行径，在国际上频频发声。还有包括中国在内的多个国家也反对印尼吞并东帝汶，联合国更是三番五次的制裁，这让印尼很被动，再加上印尼经济陷入困境，最终选择放弃东帝汶。