1959年9月21日，新安江水电站正式合拢蓄水。随即，淳安和遂安两座千年古城，连同49个乡镇、1377个村庄一同沉入水底，曾经的通衢之地，就此消失在地图上。因淳安、遂安两地在古时候属于古徽州地界，深受“诗书传家久，耕读继世长”的影响，又因为地处皖南、浙西北、赣东北交界之地，开发较早，早在三国时期，东吴名将贺齐就在此筑城，是故淳安和遂安二城颇为壮观。但因为国家的需要，只能服从大局，二城被清澈的新安江水淹没，可谓起于新安江，止于新安江是也。
随着库区水位的不断上升，29万多移民开始了漫漫移民路，起初，水位还未上升到最高值，那些不愿离开的村民选择了往高处的山地搬迁，甚至还有无处安身的移民陆续逃回故乡。后来，随着水位的不断上升，不断逼近最高水位值，移民们不得不一次又一次地迁徙。先是在周边县市、再是周边地市，最后远迁到临近的安徽、江西、福建等省，甚至最远处还有迁移到青海的。他们的付出是值得肯定和尊敬的。 而在淳安和遂安二城淹没后，在庞大的库区形成了一个人工湖，成就了两岸风光旖旎，青山绿水，大大小小的岛屿星罗棋布在湖水上，景色美不胜收。还有一个很具诗意的名字“千岛湖”，颇有“高峡出平湖”的气势，当年郭沫若先生有诗赞曰：西子三千个，群山已失高； 峰峦成岛屿，平地卷波涛。电量夺天日，泽威绝旱涝； 更生凭自力，排灌利农郊。现如今千岛湖已成为“杭州——千岛湖——黄山”这条名城、名湖、名山黄金旅游线上的一颗璀璨明珠，更有长三角“后花园”、“天然氧吧”“亚洲的五大湖区”等诸多美誉。沧海桑田，千年古城沉睡千岛湖水底；时移世易，新安江移民遍布四面八方。小小的千岛湖，折射的是伟大新中国的波澜壮阔的巨变，恐怕再也找不出新中国成立以来到今天变化如此巨大的国度和时代，谁也没有上帝视角，不管曾经先辈们怎样的选择，都已经是他们在力所能及的范围能做的最好的选择。