縣級以上公立醫院取消編制使用，保留事業單位屬性，和高校一樣，這是2017年《事業單位分類改革方案》明確規定的原則性政策。2018年3月份開始在陝西省試點，同時也在其他省市不同行政區域內展開試點。高校改革試點是在北京市開展的。
縣級以上公立醫院和高校都被劃分為公益二類事業單位，使用的是差額事業編制。對於在編人員來講，最願意聽到的改革實施辦法，就是「老人老辦法，新人新辦法」。實際上，這種改革方式，也在其中一些試點地區實施過。具體就是保留原在職人員的編制使用，直至退休、病休、調動等自然減員後，隨退隨銷，由機構編制部門將其使用的編制退一個收回一個，直至最終全部取消。對於改革後新進人員，則全部取消編制使用，實行聘用制管理。包括改革後招考、招聘醫務工作者時，公告中明確說明不使用編制。這種做法看似合理，實則根本行不通，即使在試點地區，都已經被叫停。
根據《方案》要求，高校和縣級以上公立醫院隨同事業單位分類改革一起，於2020年底前結果結束。其改革方案和人員轉隸方案，對所有參改人員統一一致，體現公正公平原則，並不會實行「老人老辦法、新人新辦法」的「一院兩制」方式。其目的就是為了激活高校和公立醫院的活力，激發專業技術人員的競爭意識，促進良性發展，更好地實現公益服務職能的本質作用。如果同一單位兩種管理制度，不僅不能體現改革目的，反而會對人事管理造成困難，顯然不符合改革要求。
縱觀事業單位「全員聘用制」管理改革實踐，也許在改革過程中，在起始階段，為了改革的平穩過渡，和社會的穩定，對老職工在實行合同制管理的時候，會從寬、優待，甚至合同管理會流於形式，但改革的大勢難以逆轉，最終會走上正規管理渠道，無數次的改革實踐，已經證明了這一點。因而對於高校和縣級以上公立醫院的在職職工來講，更快更好地接受並適應改革大潮，才是最明智的選擇。