海關稽查
是指海關自進出口貨物放行之日起3年內或者在保稅貨物、減免稅進口貨物的海關監管期限內及其後的3年內，對與進出口貨物直接有關的企業、單位的會計帳簿、會計憑證、報關單證以及其他有關資料（以下簡稱「帳簿、單證等有關資料」）和有關進出口貨物進行核查，監督其進出口活動的真實性和合法性。
海關稽查的意義
海關稽查是國際通行的海關監管制度，它改變了傳統的口岸監管模式，將海關管理延伸到企業內部和貨物通關放行後，是海關正面監管的重要手段，極大地豐富和完善了海關監管體系。多年來，海關稽查在強化海關實際監管、提升海關監管效能，監督和規範企業的進出口活動、維護正常進出口秩序，查發企業各類問題、保障國家稅收等方面發揮了重要作用。
海關稽查的對象
海關對下列與進出口貨物直接有關的企業、單位實施海關稽查：
從事對外貿易的企業、單位。
從事對外加工貿易的企業。
經營保稅業務的企業。
使用或者經營減免稅進口貨物的企業、單位。
從事報關業務的企業。
海關總署規定的與進出口貨物直接有關的其他企業、單位。
海關稽查的主要程序
01 稽查告知制度
《海關稽查條例》及其實施辦法規定的告知內容包括告知稽查的實施、告知被稽查人的權利、告知稽查結論，同時還特別規定：發現被稽查人涉嫌違法或者少征、漏徵稅款的，應當書面徵求被稽查人的意見。這充分保障了被稽查人的知情權、陳述權、申辯權以及尋求法律救濟等權利。
02 明確迴避制度
《海關稽查條例》規定，海關進行稽查時，海關工作人員與被稽查人有直接利害關係的，應當迴避；實施辦法對迴避制度進行細化規定，確保迴避制度落到實處。
03 強化監督制約機制
《海關稽查條例》明晰了內部層級核批制度，將海關行使重大稽查職權的內部核批明確規定為「經直屬海關關長或者其授權的隸屬海關關長批准」，同時還進一步完善了海關稽查執法資格制度和雙人作業制度等，規範執法行為，強化監督制約。
企業須配合海關稽查
接受並配合海關稽查是進出口企業、單位的法定義務，具體包括以下三方面：
01 依法接受海關稽查，如實反映情況，提供帳簿、單證等有關資料。
02 依法設置、編制會計帳簿、會計憑證、會計報告和其他會計資料，真實、準確、完整地記錄和反映進出口業務的有關情況，並按照規定期限保管帳簿、單證等有關資料。
03 配合海關工作，並提供必要的工作條件。海關查閱、複製被稽查人的帳簿、單證等有關資料或者進入被稽查人的生產經營場所、貨物存放場所檢查時，被稽查人的法定代表人或者主要負責人員或其指定的代表應當到場，並按照海關的要求清點帳簿、打開貨物存放場所、搬移貨物或者開啟貨物包裝。
被稽查人權利的保障
01 行政告知制度
《海關稽查條例》規定，海關在實施稽查的3日前，應書面通知被稽查人；海關實施稽查後，發現被稽查人涉嫌違法的，應當徵求被稽查人的意見，被稽查人可以對稽查認定的事實提出異議；海關在作出稽查結論時，應在稽查結論中說明作出結論的理由，並告知被稽查人的權利。
02 行政救濟制度
對於海關稽查過程中及其後續處理中的具體行政行為，被稽查人有依法提出陳述、申辯、複議、訴訟的權利。
03 海關執法權限
《海關稽查條例》規定了海關稽查中可以行使的職權，除一般性規定之外，對於一些行政強制行為和特殊情形，《海關稽查條例》對海關內部批准層級作出了嚴格限定，以更好地保護行政相對人合法權益。例如，海關不經事先通知實施稽查時，以及稽查人員在實施查詢被稽查人存款帳戶，查封、扣押帳簿、單證等有關資料和有關進出口貨物時，須經直屬海關關長或者其授權的隸屬海關關長批准。
「網際網路+稽核查」的概念
在現行稽核查制度的框架內，運用網際網路技術和手段，把實地下廠稽核查轉變為在網上遠程進行，實現隱形監管。
「網際網路+稽核查」權限的開通
被稽查企業通過「網際網路+海關」提交開通「網際網路+稽核查」的權限。
被稽查企業需使用企業電子口岸法人卡登錄，法人卡登錄後可開通「稽核查事項」所有業務、權限。如果被稽查企業使用操作員卡登錄系統，則只能查看「海關通知」。
具體開通程序為：登錄「網際網路+海關」—企業管理和稽查—企業稽核查—稽核查功能開通—簽署《企業同意書》—海關端接收後，將反饋「海關接收成功」的回執發送到企業介面。
「網際網路+稽核查」可辦理的業務
01 稽（核）查作業補充資料
提交程序為：登錄「網際網路+海關」—企業管理和稽查—企業稽核查—稽核查事項錄入—稽（核）查作業補充資料—輸入稽核查作業編號—「新增」添加資料附件。按格式要求上傳資料。
02 提交對《海關徵求意見書》反饋意見
提交程序為：登錄「網際網路+海關」—企業管理和稽查—企業稽核查—稽核查事項錄入—提交對《海關徵求意見書》反饋意見—輸入稽核查作業編號—「反饋意見」欄選擇「無異議」或「有異議」。
03 查看海關通知
查看程序為：登錄「網際網路+海關」—企業管理和稽查—企業稽核查—查看通知。海關通知內容包括送達海關稽查法律文書以及發送海關一般通知。海關一般通知包括要求企業提供相關資料，聯繫相關人員協助稽查，向企業反饋其向海關提交的主動披露報告的合規性審查結果等內容。