申請日本VAT不需要提前或同時進行歷史稅費的不申報。
1️⃣對於過往的歷史追繳，官方文件上是沒有明確說明的。大約是2019年Q4階段，日本海關開始針對非日本當地公司的跨境貿易實施逆運算徵收關稅及消費稅。其實可以理解成日本政府把消費稅收繳的動作前置了，是日本海關認可的合規清關方式。相比花費大量的人力和財務做調查調查去追繳歷史稅務，日本稅局通過逆算進行徵收，可以看出針對歷史追繳的態度。
2️⃣ 進口清關逆算實際已經規範了很多進口商的貨物清關申報流程。在這個環節，賣家是否有在合規的申報和繳納，取決於採用的是哪種方式，且在這種方式下賣家是否是合規了。如，acp的模式（通過ACP備案的清關行來繳納進口消費稅及關稅），或者傳統IOR的模式（現行的貨代的包稅包逆算模式。不論哪種清關模式，賣家在法規生效前，均已繳納進口消費稅，日本政府實際是沒有理由來追繳。
隨著2023年10月1日日本消費稅發票留存制度的生效，日本政府進一步收緊稅費的繳納流程。若您之前採用非合規的低申報包稅模式，建議您申請日本JCT後調整您的清關方式，開始使用您自己的稅號進行進口消費稅繳納，以獲取合規的稅金單用於後續申報抵扣。
3️⃣日本稅局目前沒有賣家的銷售數據信息，也沒有進一步來問亞馬遜平台要求提供真實銷售金額，但不排除日後會需要亞馬遜配合，這需要賣家知曉風險。不過賣家還需要了解的是NTA目前沒有人力來查帳查稅追繳。除非，後續日本稅局與日本海關要求亞馬遜實時提供賣家銷售數據（目前日本國稅廳並沒有要求）。歐洲就是這個現狀，查稅人工干預，這一定涉及比較大的工作量那麼就需要很長時間。
什麼情況下，我需要申報和補繳歷史稅費？
無論是日本本土企業還是海外公司，若您的歷史銷售超過免稅閾值（1000W日元），是需要註冊、申報和繳納消費稅的。但是鑒於海外企業目前已在進口環節向日本海關繳納進口消費稅，並且此方式也是日本海關認可的合規清關方式。您暫時只需要註冊日本JCT，並在稅號生效後開始進行常規申報即可。
如果我已經產生歷史稅費，我何時需要進行申報和補繳？
目前針對賣家的歷史稅務問題，賣家可以選擇主動披露或申報歷史銷售情況。您可以在申報窗口期選擇補稅或在稅局要求情況下主動配合進行補繳。
如果我選擇不補繳歷史稅費，會怎麼樣？
以目前情況來看，日本稅務機構暫時不會進行主動查稅。就目前從賣家的角度看來，我們還是比較建議您優先申請日本JCT的。因為:
首先可以保障不會受到平台政策影響而導致店鋪訂單流失就目前日本國稅廳的人力及方向看來，不會有立即性追繳風險
而且註冊日本JCT反而會提升以企業採購為目的的訂單競爭力。不註冊JCT, 店鋪將面臨訂單流失也不符合店鋪的利益。
如果您的歷史銷售已經超過了JCT申報閾值，並且不想進行補繳。若稅局進行查稅，亞馬遜可能會需要配合稅局的查稅要求，提供您的過往銷售數據，稅局可能會根據您的歷史銷售情況要求您進行補稅，並且可能會產生罰金。同時，稅局也可能會要求亞馬遜暫停您的銷售權限，直至您的歷史稅務問題解決。