到 1945 年 4 月 25 日，美軍與紅軍在易北河畔的托爾高會師。第三帝國殘存的領土被分割成了南北兩部分。它們只能通過夜間空中走廊溝通了，而且還必須保持低空飛行，以避免被敵方夜間戰鬥機擊落。北部領土上的空軍部隊全部接受帝國航空隊施圖普夫上將指揮。而南部領土上的部隊全部劃歸第 6航空隊的馮·格萊姆上將指揮。
此時的德國空軍，已無力施加任何戰略影響，只是在苦撐至終結的那一天。而在 4月 23 日，已經躲到巴伐利亞的戈林，通過無線電向柏林總理府地下室內的希特勒發去電報，要求接管權力，並允許他與盟軍展開停戰談判。戈林的背叛使希特勒怒不可遏。他立即命令駐紮在巴伐利亞的黨衛軍，將戈林和整個德國空軍指揮機構成員全部軟禁，直至幾個小時後戈林再次對他的元首表示效忠，才算罷休。
第二天，希特勒還是罷免了戈林作為空軍總司令的職務，並且命令第 6 航空隊的馮·格萊姆上將接替其職務。後者於 4 月 26日乘坐一架通訊聯絡飛機降落在柏林城區的大街上，然後前往總理府面見希特勒。在途中，他的飛機遭遇到紅軍的高射炮火，並且足部受傷。他是一瘸一拐地走到希特勒的地堡中去的。然後就被送往醫療室，躺在床上接受治療。希特勒是在床邊任命這位新任空軍總司令的。當晚，德國廣播電台正式發布了任命通告。
與此同時，柏林的戰鬥正進入高潮。4月 27 日，KG200 再次出動 7 架槲寄生，在 3架 Ju188 的引導下攻擊奧德河畔的紅軍橋頭堡。由於紅軍的嚴密防禦，出動的 7 架槲寄生中，只有 2 架 Fw190 安全返回。而且由於柏林附近濃重的煙霧，這 2 架 Fw190 無法找到機場著陸，飛行員只能跳傘逃生。
4 月 28 日凌晨，4 架 Ju52 運輸機最後一次試圖向柏林運送補給品和人員。但是全部無功而返。戰局的惡化使得柏林現在只能接受夜間空投。但這些援助無異於杯水車薪。4 月 29 日，紅軍收緊了對柏林的包圍。格萊姆奉命帶傷飛離柏林。他乘坐最後一架飛機逃離了這座城市。希特勒此時還在夢想著從柏林城外發動大規模反攻。格萊姆受命要為這次反攻提供空中支援。這當然只是南柯一夢。由於盟軍地面部隊的快速推進，德國空軍殘存的部隊正在忙於轉移基地，而不是努力打仗。而且由於燃料、彈藥和零部件短缺，大多數部隊已經癱瘓。這就是德國空軍的最後一幕。
截至此時，德國空軍尚擁有 3301 架可動用飛機。它的轟炸機部隊僅存 37 架飛機。運輸機和重型戰鬥機的數量也很少。反艦轟炸機部隊被完全解散。與 1944 年 5 月相比，只有戰鬥轟炸機的規模得到了提升，達到 712 架。
戰局惡化使得德國本土航空工業正處於危機中。許多工業設施已經被敵人占領，或正受到威脅。儘管如此，戰鬥機部隊的規模並未立即受到影響。這是因為，德國空軍仍擁有足夠的戰鬥機庫存，戰鬥損失可以輕易得到彌補。此外，燃料短缺使得這些飛機越來越多地停在地面上，良好的偽裝措施和分散配置使其避免受損。
德國空軍最後的實力統計
- 帝國航空隊
擁有 389 架可出動戰鬥機。但是噴氣式戰鬥機的總數只是剛剛超過 100 架。美軍每次出動的戰鬥機數量都能使其擁有 5比 1 的優勢。所以即便是 Me262，也很難重創敵人。它的夜間戰鬥機部隊依然強大，但是燃料短缺已使其接近癱瘓。
- 第4航空隊
駐紮在德國東南部地區、匈牙利和南斯拉夫。該部隊已經向第 6 航空隊移交了它的大部分部隊，實力縮減至 328 架飛機。
- 第6航空隊
自 1945 年 1 月份以來，該部隊獲得了大量增援，實力增至 1494 架飛機。這是目前德國空軍實力最強的戰略兵團。其他部隊原第 3 航空隊已被改編為西線指揮部，實力減至 127 架飛機。還不到 1 月份的十分之一。庫爾蘭指揮部改編自原第 1 航空隊。第 5 航空隊改編成挪威指揮部，可出動飛機總數只有 70 架。原第 2 航空隊現在是義大利指揮部，只有 63 架飛機。