我們都很想知道，如來與菩提祖師是什麼關係。
他們是師徒還是師兄弟？是互不相識的兩人還是有著深仇大恨的敵人？或是說，他倆就是同一人？從原著中所給的細節來做推斷，得到答案，其實不難。
菩提祖師是個神秘的人，他出現在西遊記最開始時，他的任務好像就是教給孫悟空法術，然後就沒了。他傳授了法力之後，為何就消失不見了呢？
與他差不多的如來，則貫穿西遊記始末，時不時地要冒泡，現身於西遊三界，在真假美猴王那一章節時，還讓他出了一把風頭，原來三界除了諦聽以外，都不能識別假孫悟空之來歷，是如來侃侃而談，說出了真相，眾人對如來的崇拜度又增添了不少。想必凡間的凡人知曉了，肯定紛紛轉投佛教，而捨棄道教了。
如來與菩提祖師有關聯嗎？或許是有的，大家看，菩提祖師居住在斜月三星洞，可這兒是西牛賀州的領地，而大家又都知道，如來才是西牛賀州的領導！如來作為大佬大神，竟然不知道在他的地盤上還有一個大佬大神存在？這不是擺明了向我們證明，如來與菩提有著大大的關係嗎？
他們之間又是何種關係？我想，如來在降服孫悟空時，脫口而出的九個字，便可向我們證明。菩提正是如來本人！
記得，孫悟空大鬧天宮，惹得天庭眾神拿他絲毫沒有辦法時候，如來跑過來，是這樣跟他說的，如來先是跟他諮詢一番，問他為何要這樣做？問他有大好的資質，師父又是高人，為何要做這種與眾神為敵的勾當，甚至在最後還丟出這樣一句話：可惜了你的本來面目！
如來的這九個字意味深長，孫悟空的本來面目是啥呢？如來此言，是否在暗示著什麼？
孫悟空的本來面目是啥，如來之所以清楚，是因為他就是菩提祖師本人！
因為孫悟空當初學藝於菩提祖師時，便想菩提祖師透露了自己的身世，又是經過十來年的相處，菩提祖師早已對孫悟空知根知底。然而，此時如來不過是跟孫悟空有過三句兩句的言語交談，竟知道了孫悟空的本來面目，想見，如來正是菩提祖師，所以才能對孫悟空如此熟悉的。
我們把菩提祖師搞得如此神秘幹嘛呢？其實，一個人不會憑空出現，更不會無故消失的，菩提祖師在原著第二回便消失不見了，他其實根本沒有消失，只是換了一種形式存在了——搞得跟愛因斯坦一樣了。菩提祖師「消失」之後，變換了一種形式，便是以如來佛的身份現身於西遊三界，出現在你我面前。
我們知道，孫悟空到最後成佛了，豬八戒沙僧卻不能，拋去真正的功勞不談，或許當中摻雜了如來對於孫悟空的私人感情，也就是菩提祖師對於孫悟空的感情。大愛之心是長存心間的，而私愛，卻也時不時會散發一點出來的，菩提祖師（如來）跟孫悟空做了十年的師徒，怎會沒有感情？如來（菩提祖師）對於孫悟空的感情怎會不強於八戒與沙僧呢？