真菌感染是很多圈養動物易患的傳染病，包括淺表、深部和全身性感染，龜類也會有真菌感染的情況發生。並且水龜、半水龜、陸龜都有被感染的可能。過高的濕度、過低的環境溫度、惡劣的生活環境、營養不良或其他應激因素都可能導致龜患上真菌感染。系統性真菌病的發病機制尚不清楚，但保持良好的衛生條件和飼養環境可減少感染的機率。
1. 常見症狀
龜的真菌感染症狀一般表現為龜甲或皮膚上有白色或灰色的模糊斑點。會伴隨著出現龜甲或皮膚的脫落、脫皮、起泡或出現奶酪狀物質。正常的龜甲或皮膚脫落不會產生白斑、發紅或腫脹。如果這種感染持續過長時間得不到及時治療，有可能發展成更嚴重的全身感染或骨組織深處的潰瘍性膿腫。
判斷症狀時，要區分龜身上是水鹼沉積還是真菌感染，因為這兩種原因都會導致龜甲變白。有三個簡單的方法：將龜放入水中，如果是水鹼沉積，那白色會逐漸變淡直到消失，如果是真菌感染則變化不大。水鹼就是硬水的水垢沉積，呈鹼性，所以用牙刷沾點醋，在龜甲上刷一刷，能刷掉的是水鹼，刷不掉就是真菌感染。觀察，水鹼沉積一般表面粗糙，覆蓋龜甲大片區域，真菌感染一般從一個點或幾個點向四周蔓延。
2. 真菌感染的原因
——水龜、半水龜的真菌感染
水龜和半水龜患真菌感染的主要原因有兩個，第一個是水質差，第二個是龜曬太陽太少或曬台搭建不合理。龜在水箱裡吃東西也在水箱裡排泄，如果水箱不能經常的、徹底的清理，食物殘渣和糞便會落到底部並混在一起，變成了滋生細菌和真菌的溫床。再加上水箱的溫度，更加給細菌和真菌的存活和生長提供了條件，龜長期生活在這種水質差的環境中很容易真菌感染。曬區的位置不好或者不夠大導致龜不能完全的離開水並且吸收足夠的熱量充分乾燥來殺菌，也容易患上真菌感染。
——陸龜的真菌感染
很少待在水裡的陸龜為什麼也會真菌感染呢？首先，飼養箱內的墊材濕度過大會大量的滋生細菌和真菌，龜生活在這種環境中，皮膚和盾甲就會有真菌感染的風險。其次，在龜甲或身體受到損傷的時候，哪怕很小的傷，磕碰產生的外傷、龜混養導致的咬傷，甚至蜱蟲的叮咬，都可能導致不受歡迎的細菌、真菌或其他病原體進入原本表皮堅硬的盾片下方的身體組織。
3. 真菌感染的治療
真菌感染具有傳染性，所以發現龜患有真菌感染後，要馬上隔離治療，以免將其他龜傳染。另外，早期治療要容易很多，長時間得不到治療，後果可能是致命的，所以最好及早發現，及早治療。
如果龜的身體原本健康，而且已經確定白斑是真菌感染，治癒相對容易一些，但和人得上真菌感染一樣，治癒需要一些時間和耐心。對於水龜和半水龜，方法如下:將龜從水箱裡拿出來，徹底清洗水箱。把龜放入到水溫在26℃的容器中，往水裡加兩勺鹽，讓龜在鹽水中浸泡大約15分鐘，每天1次或2次，連續4或5天，將龜從水中取出後乾燥約一個小時，再把它放回水箱。建議混養在一起，但沒有得病的龜也做一段時間的鹽浴來殺菌。如果真菌感染擴散的面積比較大，那麼需要藥物來幫助治療，把龜從水箱裡拿出來，等它完全乾燥，用棉簽把磺胺嘧啶銀霜或鹽酸特比萘芬軟膏塗抹在真菌斑點上，每天一次，塗藥之後要干養一段時間，讓藥物發揮作用，可以白天塗藥，晚上放回水中，放回水中之前要把藥擦掉。如果可能的話，干養期間將龜放在一個26℃左右較溫暖的地方。堅持每天用藥，並注意外殼是否開始改善。
對於陸龜，方法類似，將龜刷洗乾淨，乾燥後塗抹藥物治療，需要注意的是要更換墊材，保證飼養箱的清潔，保證箱內通風，控制飼養箱的溫濕度，還要注意混養的龜有沒有相互攻擊的行為，如果有，要分開喂養，外傷也是導致真菌感染的途徑之一。
4. 清洗飼養箱並保持其清潔
當龜在接受治療的時候，建議把水箱裡的水全部倒掉，徹底的清洗水箱並消毒，要確定清洗到水箱的每一個角落和水箱內所有設備和造景，過濾器、曬台、石頭等等。所有物品完全乾燥或日曬消毒後，注入新水，將龜重新放回水箱。過濾器對於保持水質是一個很有用的設備，已經安裝了過濾器，也檢查一下過濾器功率是否能滿足需要。做完了清潔工作，配備了過濾器，還有一個很重要的工作就是要定期換水，建議以下換水頻率:
小型龜缸——每2天更換20%的水，每10-12天更換全部的水。
中型至大型龜缸——每5天更換50%的水。每12-14天更換全部的水。
高品質，高容量的外部過濾器——每7天更換50%的水。每17-19天更換全部的水。
這樣，有害的細菌和真菌就會逐漸清除，有益的細菌能夠存活下來，這是一個好的循環的開始。喂食的時候要及時清理剩餘的食物，保證水質乾淨。如果你的龜總是在濕的、冷的和髒的環境下生活，那它可能不僅會成為真菌感染的受害者，而且很可能會發展成更嚴重的疾病，如腐甲和呼吸道感染等。
5. 總結
最後，定期完成這幾項操作來預防你的龜得上真菌感染。給龜一個好的生活環境，定期換水，定期清理飼養箱。保持龜的飲食均衡，在龜的飲食中適當添加維生素補充劑。保證足夠的UVB燈或太陽光照射，並提供一個足夠大的曬太陽區域讓它能完全離開水，曬太陽燈對龜的健康至關重要，因為它不僅能使龜乾燥殺菌，同時也能保證龜需要的溫度和熱量。給龜提供合適的水溫，並且避免剩餘的食物污染水質。龜得病是難免的事，儘量及時發現，給予合適的治療，痊癒的可能性才會最大。