文 | 馮唯唯
2月3日,《自然》雜誌在線發表了來自中國學者的兩篇關於新冠狀病毒(2019-nCov)的研究結果。
新型冠狀病毒分析
在其中一篇研究論文中,中科院武漢病毒所研究員石正麗及同事對引發呼吸系統疾病的2019-nCov進行了鑑定和表征,揭示了其與嚴重急性呼吸綜合徵(SARS)冠狀病毒的相似性。
這篇文章發現了新型冠狀病毒來源於蝙蝠的證據,但是此次爆發的動物來源尚待確認。
冠狀病毒一直是人類傳染病流行的一個來源,如SARS和中東呼吸綜合徵(MERS)都是由冠狀病毒引起的。SARS相關的冠狀病毒主要是在蝙蝠等哺乳動物體內被發現的,對公共健康構成了潛在威脅。
據報道,此次疫情或在2019年起源於武漢市一海鮮市場。
患者症狀包括發燒、氣促和肺炎。此後疫情已蔓延至中國其他地區及海外。
截至發稿時,目前已發現超過17000例病例,死亡人數超過300人。
石正麗及同事分析了7例重症肺炎患者的樣本,其中6人為武漢海鮮市場內的工人,該海鮮市場在2019年12月首次發現病例。
研究者發現在其中5名病人身上獲取的全長度基因組序列彼此之間幾乎完全一致(相似度超過99.9%),與SARS冠狀病毒有79.5%的序列一致。
此外,研究人員發現,該病毒序列與一種蝙蝠冠狀病毒在全基因組水平上相似度高達96%,表明蝙蝠可能是該冠狀病毒的來源。
研究人員發現七個被鑑定和測序出的非結構性蛋白也存在於SARS冠狀病毒中,表明該病毒是一種與SARS相關的冠狀病毒,作者暫時將其命名為新型冠狀病毒(或2019-nCoV)。
他們確認了2019-nCoV進入細胞的路徑與SARS冠狀病毒一樣,即通過ACE2細胞受體。
從感染2019-nCoV的病人體內分理出的抗體顯示出在低血清稀釋度下中和病毒的潛力,但是抗SARS病毒抗體是否能與2019-CoV交叉反應,仍需用從SARS病毒感染中痊癒的病人的血清來確認。
作者開發出了一種可以將2019-nCoV與其他所有人類冠狀病毒區分開的測試,並展示在最初的口腔拭子樣本中檢測到了2019-nCoV,但隨後(大約十天後)採集的樣本沒有顯示陽性病毒結果。
這項發現表明,最有可能的病毒傳播途徑是通過個體的呼吸道,不過作者也指出其他途徑亦不無可能,仍需更多患者數據來進一步研究傳播途徑。
此前,相關成果於1月23日發表於生物預印文本庫BioRxiv
(https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v2)。
《自然》論文連結:
https://nature.com/articles/s41586-020-2012-7
新型冠狀病毒的基因組序列
另一篇《自然》論文則介紹了上海公共衛生臨床中心和復旦大學公共衛生學院教授張永振等人對2019-nCov的基因組序列的分析。
該病毒基因組從就職於出現首批患者的海鮮市場的一名病人身上獲得。
基因組分析顯示,該病毒與此前在中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關。
最近出現在武漢的一種2019-nCov已傳播到中國其他地區和其他幾個國家,其中包括美國、德國和日本。
首例患者於2019年12月12日被收治入院,調查發現武漢一家同時銷售野生動物的海鮮市場或是此次疫情的潛在來源。
張永振等研究了一名41歲的男性海鮮市場工人,其於2019年12月26日在武漢一家醫院住院,表現出呼吸系統疾病症狀,包括發燒、胸悶和咳嗽。
聯合使用抗生素、抗病毒藥和糖皮質激素進行治療,但患者表現出呼吸衰竭,治療三天後病情無改善。
作者對從患者收集的支氣管肺泡灌洗液(肺分泌物)進行了基因組測序。
他們鑑定出了一種新型病毒,並發現該病毒基因組與蝙蝠體內發現的SARS樣冠狀病毒有89.1%的核苷酸相似性。
作者表示,儘管從單個患者的分析中不可能得出該冠狀病毒是當前疫情爆發原因的結論,不過這些發現已被針對其他患者的獨立調查研究證實。
相關序列信息1月10日發表於病毒學網站(http://virological.org/t/novel-2019-coronavirus-genome/319)。
《自然》論文連結:
https://nature.com/articles/s41586-020-2008-3
另,2月3日,施普林格·自然(SpringerNature)集團設立了冠狀病毒文章資源網頁。
施普林格·自然從旗下期刊中整理了最新發表的與冠狀病毒研究最相關的論文,並與相關評論文章和書籍一起匯總於這個專題網頁。
該網頁將持續更新,其中的所有內容可免費獲取。
當天,施普林格·自然還簽署了名為「分享與新型冠狀病毒(nCoV)爆發相關的研究數據和成果」的共識聲明,使讀者能夠快速、直接獲取最新的現有研究、證據和數據,來支持全球應對日益爆發的新冠狀病毒疫情。
施普林格·自然相關冠狀病毒文章資源網頁:
https://www.springernature.com/gp/researchers/campaigns/coronavirus
文章來源: https://twgreatdaily.com/zh-tw/e3H3EXABjYh_GJGV-FWu.html