杜鵬宇出生於河北保定，7歲時被父親送去學羽毛球，但因為當時的河北省羽毛球隊並不活躍，為了使兒子得到更好的發展，父親毅然決定將杜鵬宇送到北京學習。在北京市一隊學習一年多以後，2003年底杜鵬宇順利進入國家青年隊，並在2006年奪得全國青年羽毛球錦標賽的單打及團體冠軍。
杜鵬宇不屬於有太多天賦的選手，他給人印象最深刻的就是他在比賽中的拼勁，不管是比分領先還是落後之時，他總是像一隻不知疲倦的永動機，滿場飛奔，哪怕輸掉比賽，也會讓對手贏得很痛苦，因此外界都稱他為「拚命三郎」，也有球迷稱他為「杜三局」，因為比賽時他往往會在不利的情勢下堅持到第三局扭轉局面。
2014年湯姆斯杯之後，杜鵬宇逐漸淡出了人們的視野，在世錦賽大名單公布之前，杜鵬宇退役的消息也傳來。26歲的杜鵬宇在正當打之年突然退役，讓很多人不理解，但杜鵬宇卻有著自己的苦衷。
退役後他回到老家河北開了一家羽毛球用品店，工作的勤奮程度絲毫不亞於球員時代，相比於其他隊友轉職做教練，杜鵬宇的退役生活略顯平淡：「就是賣羽毛球用品，也去做一些簡單的少兒培訓，畢竟做別的東西也不懂。」
2016年，杜鵬宇收到了原母隊北京隊的邀約，為了全運會復出。退役已經3年的他打敗了當時世界排名第九的香港選手伍家朗，狀態令人稱讚。
杜鵬宇的職業生涯時期，林丹、陳金、諶龍等幾位主力幾乎組成了中國男單最強陣容，這對他來說既是慶幸也是可惜，慶幸的是和偉大的球員生於同一個時代，可惜的是機會也相應的少了很多。