封神之战发生在商朝和周朝更替时期，甚至可以说，商朝的灭亡都是天上的仙神们所主导的。商纣王帝辛原本是一位英明神武的帝王，他有能力、有雄心更有气运，原本奄奄一息的商王朝，在商纣王帝辛统治时期，商王朝甚至有了再度崛起的可能性。但圣人女娲的出现，让这一切都成为了泡影。
女娲娘娘作为天道圣人，却因为商纣王帝辛的一首“亵渎”诗而大发雷霆（其实也没有太过亵渎，除了最后一句“取回长乐侍君王”外，其他的都是赞美女娲娘娘的）；她使用招妖幡招来万妖，并让轩辕坟三妖前去覆灭商王朝。在轩辕坟三妖中的九尾狐影响下，商纣王帝辛开始变得暴戾起来，从而为商朝埋下了灭国之祸。
其实，女娲娘娘乃是修为有成的天道圣人，又哪有那么容易动怒？很显然，这一切是早就被安排好了的，谁安排的呢？其实答案是显而易见的，除了鸿钧老祖这位超脱天道圣人的道祖外，还能有谁？昊天上帝发布封神榜，阐教的元始天尊、截教的通天教主和人教的太上老君都不敢反对，可见昊天上帝的这道谕旨应该是鸿钧老祖的意思，不然昊天上帝能命令得了他们三个？
在鸿钧老祖的授意下，女娲娘娘当然也是欣然答应了，一场针对商纣王帝辛的阴谋就此展开，并因此，最终引发了商周大战。但截教和阐教联军对此战的态度却是截然不同，截教门人消极抵抗，而阐教联军虽然论整体实力不如截教，但却是以点击面，加上有数位天道圣人的相助，故而截教损失惨重。
随着截教门人纷纷战死，终于，在三霄娘娘被元始天尊和太上老君这两位天道圣人联手击败后，通天教主再也受不了阐教联军的欺负，布下了“诛仙剑阵”。但阐教联军这一方，偏偏就有太上老君、元始天尊和西方教的接引道人、准提道人这四位天道圣人，所以“诛仙剑阵”也被破了，连四把剑都被抢走了。
在此战中，截教的副教主多宝道人见师尊被联手欺负，悲愤之下挥剑偷袭太上老君，结果反被太上老君用风火蒲团卷起生擒了。虽然书中并没有明确说多宝道人的结局，但却有一句描述多宝道人的诗句：多宝西方拜释迦，暗示了多宝道人后来皈依佛门。
在此战之后，截教之败已无力回天，但通天教主仍是想博一下，于是就有了后来的“万仙阵”；但面对天道圣人的围攻，这无疑是一面倒的屠戮，尤其是手持“万仙阵”核心的长耳定光仙临阵倒戈；败局已定，接下来就是鸿钧老祖出面，调停双方，带走了通天教主；然后西方教开始收获胜利的果实，带走了绝大部分截教门人。
虽然这场战争最终是以阐教联军胜利而告终，但阐教也是损失惨重，尤其是在战后；在战后，不仅阐教的文殊广法天尊、普贤真人和慈航道人这三大高手加入了西方教，成为了三大士；而且阐教的副教主燃灯道人也是离开阐教加入了西方教，成了西方教的燃灯古佛，应了那句“万佛班首，祖佛源流”。
原本这场“封神之战”只是东方仙界的战争，但因为元始天尊的私心，引入了西方教的接引道人和准提道人；虽然最终阐教胜了，但其实真正得到好处的却唯有西方教而已。天庭的三百六十五路正神是早就定下的，但接引道人和准提道人却在途中不断的抢夺法宝和吸纳双方门人。此战后，东方仙界颓势已现，西方教强势崛起，当然，这是后话了。