乙肝病毒彻底清除且永不复发，是肝病医生和乙肝患者的共同心愿，但是当前的治疗手段还不能实现这一目标。
目前，对于广大乙肝肝友来说，积极的抗病毒治疗才是慢乙肝治疗关键，因此在抗病毒治疗前了解治疗的预期目标才能够让肝友们更好地理解和依从治疗方案，同时对战胜乙肝的信心十足。
综合国内外权威指南的建议与临床实践的经验，可以把乙肝抗病毒治疗的疗效过程粗略地分为以下三级目标：
第一级目标
病毒定量阴转，长期维持病毒学应答
这是进行抗病毒的基本目标，病毒定量阴转（HBV DNA检测不到），也叫做病毒学应答。干扰素治疗与核苷类治疗都能实现这一基本目标，且后者在这方面具有优势。
值得注意的是达到这一目标并不意味着马上停止治疗，因为此时的DNA阴性，全靠药物抑制了DNA的复制过程中的关键步骤，病毒在大本营依然活跃，所以一旦停药，病毒DNA很快就会再次升高，甚至会导致重症肝炎。
所以，切记要继续治疗，争取实现第二、第三个层次的目标。
第二级目标
在HBVDNA持续阴性的基础上，实现ALT复常，e抗原血清学转换，且停药后应答持久。
e抗原阳性的慢乙肝在实现第一个目标之后继续治疗，有部分患者可以实现e抗原血清学转换，即e抗原阴转、e抗体出现，这体现着机体免疫系统和乙肝病毒之间的力量消长发生重大转机，实现了部分免疫控制。
这个时候停药，能获得持久应答的概率相对会高，但是停药后再次反跳的比例也不在少数，所以对于实现e抗原血清学转换之后，也需要巩固治疗至少3年，总疗程至少达到4年，停药后维持应答的概率会相对高，延长疗程可减少复发。
相对核苷类治疗，干扰素治疗实现e抗原血清学转换的几率相对高，停药后3年的e抗原血清学转换率在三分之一左右。
第三级目标
在第二级目标的基础上实现表面抗原清除，表面抗原清除就是“功能性治愈”，实现这一目标的患者停药后复发的几率非常低。实现这一目标的患者不多，不过随着抗病毒治疗策略的改善，例如干扰素延长治疗、联合核苷类治疗，实现表面抗原清除的患者已有所增加。
随着抗病毒治疗药物的可及性的提高，越来越多的慢乙肝患者期望获得更好的疗效，清楚目标，遵循医嘱，依从治疗，将会离更好的治疗效果更进一步。