農民種茭白，茭白的選種可以說是茭白生產的關鍵技術環節之一。為何種茭白生產提倡要年年進行選種呢？
這是因為茭白產品的形成受到茭白植株本身遺傳基礎、菰黑粉菌遺傳基礎以及環境條件的綜合影響。但是彌黑粉菌相對更容易受到環境的作用，而使茭白植株和菰黑粉菌之間的關係受到影響。所以，在一般茭白栽培田內都會或多或少地出現一些雄茭 和灰菱。有些植株雖然表現為正常茭，但在熟性、品質等性狀上也發生較大變異，而且往往是劣變。
此外，茭白植株游茭發生量較大，游茭發生的植株雄茭率較高，連續用游菱作種，雄茭率會增高很快。在連作田或一次定植多年栽培的田塊，這種情況更容易發生。因此，茭白生產上十分強調年年選種。
茭白如何進行選種？
茭白選種的方法有以下兩種:
(1)早茭選種法
早茭在採收四月茭時，選擇行間由匍匐莖萌生的分株為初選種株。入選分株必須具備三個條件：一是結菱早而肥大，不易發青，並在兩側各帶有一個分藥；二是匍匍莖相連的母株，必須結茭齊集、早熟、無雄茭；三是分株四周鄰近的分株也沒有雄茭。
符合這三個標準的分株，挖起寄栽田岸邊，並摘去主莖上的茭白，促使其上兩個分櫱成長。當年秋季，將分櫱上萌生的二次分櫱於立秋進行分株。秋茭採收時，再觀察其上有無灰茭。第二年清明至穀雨期間，將初選的茭墩進行分墩繁殖，秋季採收秋茭時，再選擇薹管短、結茭早而齊集、茭墩中仍無灰茭及雄茭發生的單株為複選種株。
其中優良的種株，於第二年夏茭採收時，再鑑定其品質和早熟豐產的性能。經過三年選種，其中結茭早、品質好、一墩中沒有一支雄茭和灰茭的茭株，作為入選良種，移栽藕塘二邊，株行距為(43~46)厘米X(43~46)厘米，稱為茭秧基，為下一年繁殖的種株。一般的種株分墩栽於藕塘四周，株行距為(27~30)厘米X(27~30)厘米， 立秋後栽入大田，即為生產用種。
(2) 晚茭選種法
中晚熟品種要求高產、齊集，多進行墩選。一般經1~2年選成。第一年在秋茭採收時，選無灰茭的優良單株，插竿或壓泥作為標記，發現雄茭及灰茭，將葉片打結作為記號；第二年春季分墩時，先將灰茭及雄茭連根挖去，以免混淆。無灰茭的植株可作為種株分栽，每畝需種株200~300墩。
晚熟品種除選擇秋茭外，還應在夏茭萌芽及採收時進行選種，要求分櫱長勢一致。入選的種株不採其上茭白，在芒種夏至間將老墩進行分株，每小墩帶有1~2個分集，行距70厘米，株距50厘米，秋季淘汰灰菱植株，第二年便可切墩作為生產用種。