在五四運動101周年到來之際，共青團中央公布2019年度「全國優秀共青團員」「全國優秀共青團幹部」「全國五四紅旗團委(團支部)」等表彰決定，溫州醫科大學團委榮獲「全國五四紅旗團委」榮譽稱號，是華東地區唯一一所今年獲此殊榮的醫科大學團委。
溫州醫科大學團委聚焦共青團主責主業，以幹事創業的心態積極做好團工作，為黨爭取青年人心、匯聚青年力量。溫州醫科大學團委以深化團學組織改革為根本點，推動新時代共青團組織凝聚力建設。推進青年思政引領工作，湧現全國向上向善好青年、全國優秀共青團幹部、全國高校活力團支部、省五四紅旗團委等典型。承辦全國醫藥類高校共青團工作聯盟年會。以青春戰疫為閃光點，在抗擊疫情中彰顯青春擔當。以「大學生科研訓練計劃」為平台，培育學生創新實踐能力。挑戰杯最好成績全國第三，連續四次獲優勝杯，3人獲中國青少年科技創新獎，1團隊獲小平科技創新團隊，8項作品獲「挑戰杯」創新創業系列競賽全國特等獎（金獎）等。
「全國五四紅旗團委」是新形勢下全面推動共青團改革、推進團的基層組織建設、活躍基層團工作的重要載體，是團中央授予基層團組織的最高榮譽。此次溫州醫科大學團委榮獲「全國五四紅旗團委」榮譽稱號，是對全體醫學類高校共青團工作的肯定，也是對醫學類高校各級團組織和廣大團員青年的鼓舞，激勵各級繼續堅持堅持黨有號召、團有行動，引領廣大團員青年堅定理想信念，不懼風雨、勇挑重擔，為推進我省「重要窗口」建設匯聚磅礴青春力量。