在《笑傲江湖》中，少林和武當是真正的正教魁首（雖是少林第一武當第二但兩派的大利益一致），無論影響力還是實力都在五嶽聯盟之上（尤其是影響力），值得玩味的是，和《倚天屠龍記時代》兩派關係不佳相反，笑傲中少林武當是一個牢不可破的同盟，方證、沖虛兩大掌門人，大事上意見一致，常常一同出入。正是兩大超級大派形成同盟，在一定程度上制定了整個正教同盟的秩序。

少林派向為武林領袖，數百年來眾所公認。少林之次，便是武當。

少林寺

先來介紹一下少林寺的實力，說起少林，首當其衝的當時少林方丈，與金庸其他小說少林方丈的實力不足不同，笑傲江湖的方證大師可謂存在感十足，是正派三大高手之首。

方證的武功在書中表現只有兩處，一處是在少林三戰中對陣日月神教教主任我行，方證所使用的千手如來掌是當世最高深的掌法，而修習的易筋經更是最厲害的內功，能夠完全壓制吸星大法，而且也不用消耗自己太多內力，在與任我行一戰中，任我行先是內力被隔空壓制，第三次對掌就打得其全身氣血都受到了影響，若不是任我行使詐，久戰之下必敗無疑，而任我行是什麼人物？那可是能令獨孤求敗、風清揚歡喜不盡的大高手，而更勝一籌的方證實力就更毋庸置疑，在整個金書中也是排的上號的。

.獨孤求敗如若復生，又或風清揚親臨，能遇到這樣的對手，也當【歡喜不盡】。

方證還有一處武功表現是在笑傲結尾，一聲金剛獅子吼將桃谷六仙吼暈在地，連沖虛道長在遭受餘波波及後到站立不穩。桃谷六仙聯手連左冷禪都無勝他們的把握，沖虛也是正派三大高手之一，卻被方證一嗓子給秒了，實力可謂恐怖如斯。

方證大師眼見危機只在頃刻之間，可又不能出聲勸阻，泄漏了機關，當即快步入殿，大聲說道：「貴客在外，不可爭鬧，別吵！」這「別吵」二字，是運起了少林派至高無上內功「金剛禪獅子吼」功夫，【一股內家勁力，【對準】了桃谷六仙噴去。】沖虛道長只覺【頭腦一暈，險些摔倒】。【桃谷六仙已同時昏迷不醒。】

在人數上，少林寺人多勢眾，黃伯流曾說少林僧眾不在千人之下，而令狐沖曾評價少林一派實力就在五嶽聯盟之上，固然，他不會知道嵩山派的隱藏實力，但從左冷禪的態度可知，就算是加上這部分隱藏勢力，五嶽派也不大可能與少林比肩。

最後再看看下面一段原文：

祖千秋道："是誰這樣厲害，一舉將少林派的四名好手殺了？"老頭子囁嚅道："莫非……莫非是黑木崖上的人物？甚至是東方教主自己？"計無施道："瞧來倒也甚像。咱們趕緊把這四具屍體埋了，免得給少林派中人瞧出蹤跡。"

祖千秋、老頭子等人對岳不群這個華山派掌門並不如何放在眼裡，然而看見幾個少林弟子的屍體，卻鄭重萬分著急忙慌的掩埋屍體，還疑神疑鬼的想著有誰能殺幾名少林弟子，甚至想到了東方不敗身上，足見少林對這些邪道散人的威懾力和五嶽劍派完全不在一個量級。

武當派

跟少林相比，笑傲中的武當似乎沒有表現出兩大派齊名的實力，少林出場高手只有方證、方生兩人，卻有左冷禪提到的少林寺內有二三十位一等一的高手。武當就沒有這種待遇了，給人的感覺除了沖虛和成外就沒多少高手了，但在書末武當卻搞了大新聞，展示了這個超級大派的實力。

沖虛道："清虛師弟又另有布置，倘若任我行竟然不坐，叫人拿下椅套、椅墊，甚或拆開椅子瞧瞧，只要一拆動，一樣的引發機關。玄高師侄這次帶到寶山來的，共有二萬斤炸藥。毀壞寶山靈景，恐怕是在所不免的了。"

沖虛道："我這位師弟和師侄，劍術算不得很精，但他們年輕之時，曾在西域住過十幾年，卻各學得一項特別本事，一個精擅機關削器之術，一個則善制炸藥。"

沖虛道："正是。玄高師侄從明日一早起，便要在十三條上落山峰的要道之中，每一條路選擇幾個最險要的所在，埋藏強力地雷，地雷一炸，上山下山，道路全斷。

武當派竟然有精研火藥學的人才！這可謂是相當不武俠的設定了，倚天屠龍記中，周芷若的峨眉派就來過一次霹靂雷火彈，但那雷火彈一次只能攻擊一人且數量有限，和這次武當派的手段簡直不可同日而語。此外，沖虛道長雖然不及方證，但也是正派頂尖人才，太極劍法神乎其神，全無破綻，令狐沖冒著斷臂的危險方才用獨孤九劍破了其劍勢，沖虛也是任我行宣稱最佩服的三個半人之中的一個。