目前B肝抗病毒治療為大家所接受，一線治療藥物恩替卡韋和替諾福韋現在價格也可及。但在抗病毒治療中需要清楚以下幾個方面的問題。
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一、B肝抗病毒治療堅持是關鍵
B肝抗病毒治療是一個長期的過程，很多B肝患者由於長期服藥產生心理壓力和經濟壓力，不能堅持規範治療。因此，需要經常對患者進行B肝方面的健康教育。從專業角度來說，共價閉合環狀DNA(即cccDNA)作為B肝病毒複製的「模板」，是B型肝炎病毒複製中重要的中間產物，一旦它在肝細胞核內形成，就具有了高度的穩定性，可長期存在於肝細胞內，病毒按此「模板」源源不斷地複製出許多新的病毒。所以，需要一個長期的過程來抑制病毒複製。另外，在治療的過程中要定期監測療效、副作用、肝功能、疾病進展情況等。
二、停藥時機的選擇
在臨床上，經常有患者過早停藥導致更嚴重的問題出現，如一般的慢性肝炎可出現病毒反彈，肝功能惡化甚至導致肝衰竭，肝硬化患者盲目停藥發生肝衰竭的可能性更大。所以，抗病毒治療停藥不能盲目，要諮詢醫生，對治療效果進行全面評估後決定停藥時間。
鑒於目前治療藥物的局限性等原因，即使達到目前指南或專家共識提出的所謂停藥標準，雖然有部分患者可以考慮停藥，但並不是所有患者一定都能停藥，一定要在醫生指導下選擇是否停藥並進行密切隨訪監測。如肝硬化患者即使達到停藥標準也不能隨意自行停藥，在臨床上也常出現肝硬化患者抗病毒治療8年多，B肝表面抗原消失了，但一停藥很快就復發了。
現在並沒有特別肯定的抗病毒治療停藥指標，達到了停藥標準並不等於停藥後絕對不復發，停藥後也存在復發風險，只是有些患者維持療效的時間可能相對長些。所以，即使患者達到停藥標準停藥，也要進行長期的隨訪，監測是否病情復發、是否出現肝硬化、肝癌及其併發症等。有些B型肝炎達到臨床治癒的標準，但不注意定期複查，甚至還酗酒，也會發生肝硬化、肝癌。因此，一旦感染過B肝，則需要長期乃至終身監測。
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三、B肝可母嬰阻斷
B肝母嬰阻斷也是大家非常關注的問題。目前，我國隨著B肝疫苗的普遍接種，兒童感染率明顯下降。
慢性B肝或者肝硬化的患者，一般需要長期抗病毒治療，此類適齡的女性患者在肝臟功能等全面評估比較安全的情況下，是可以考慮懷孕的，抗B型肝炎病毒藥物可選擇替諾福韋等妊娠安全性較好的藥物。單純的B肝病毒攜帶者有妊娠需求時，需要進行B肝母嬰阻斷，對於高病毒載量的患者可能不需要長期用藥，可在妊娠的後期啟動替諾福韋等妊娠安全性較好的口服抗病毒藥物治療，減少病毒載量，並結合新生兒疫苗接種等措施，從而降低母嬰傳播。另外，B肝媽媽可以根據自身情況，聽取醫生建議後，選擇母乳喂養或其它方式喂養。當然，醫患之間良好的溝通、相互信任是非常重要的。
四、提高認識，早篩查
目前B肝防治還存在一些誤區，有些人談肝色變，認為一般生活接觸甚至空氣可以傳染，存在B肝歧視現象；而還有些人對B肝的防治意識不強。因此，需要提高公眾對B肝的科學認識，了解哪些是高危因素，如何進行B肝篩查、如何進行科學防治，更要認識到B肝是可防可控的，從而克服恐懼心理。目前我國B肝防治工作已經取得很大成績，未來還將有更大進展，對此應充滿信心。樂觀向上的心態、健康的生活方式及科學防治是十分重要的。