清朝康熙三十四年(1695年)由齊齊哈爾城至黑龍江城(今黑河市愛輝鎮)設「博爾多站」。
清朝光緒三十二年(1906年)以嫩江為界,分設東、西兩路布特哈總管,東路布特哈總管衙署駐博爾多站。
清朝宣統二年(1910年),裁撤東布特哈總管,改設訥河直隸廳,駐博爾多城,成為廳署駐地。
民國二年(1913年)設置訥河縣。
1946年原中共嫩江省委、省政府移駐訥河。
1992年9月2日,撤銷訥河縣,設立訥河市,改由省直轄為齊齊哈爾市代管
現在,訥河市面積6664平方公里,相當於6個香港的面積。
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