陳凱歌導演影片《趙氏孤兒》與紀君祥元雜劇《趙氏孤兒》大體主線相同，都是屠岸賈殺了趙盾全族，程嬰用自己的孩子換下趙氏孤兒，將其撫養成人，最終報仇雪恨的故事。
（一）
元雜劇中的趙盾是個忠臣，為人正直，很得人心；屠岸賈是個佞臣，凶暴殘忍，專權誤國。雙方的矛盾，已有劍拔弩張之勢。當時西戎國進貢一條神獒，晉靈公賜給了屠岸賈，屠岸賈扎了一個草人，打扮成趙盾的樣子，訓練它撲食。屠岸賈在大殿上說神獒最有靈性，識得不忠不孝之人，之後神獒撲上趙盾就咬，多虧殿上的太尉提彌明把狗殺了。趙盾跑出殿門，車已經被屠岸賈卸下了兩匹馬和一個輪子，壯士靈輒一手策馬，逢山開路，將趙盾救走。靈輒曾經差一點餓死在桑樹下，是趙盾給他酒飯，讓他飽餐一頓，如今他便是來報一飯之恩的。屠岸賈害趙盾不成，又在晉靈公面前進讒言，將趙盾一家三百口滿門抄斬。
影片中趙盾和屠岸賈都是權臣，都不把國君放在眼裡，二人同樣勢不兩立，水火不容。趙盾兒子趙朔打了勝仗，想讓國君去迎接，晉靈公送了個「禮物」，用彈弓打了趙朔的馬，顯然是君弱臣強，他以此惡作劇的形式來發泄不滿。趙盾當場質問屠岸賈，趙朔說打了馬是小事，帶壞了國君才是大事。屠岸賈儘管冤屈，在此情勢下也只能忍辱吞下打傷馬的彈丸。趙朔夫人莊姬即將生子，趙朔公然在朝堂上對屠岸賈說：「大人的兒子要是活著的話，也該有孩子了吧。」趙家在晉國已然不可一世。
影片中咬趙盾的狗是一隻神鬣，屠岸賈用的是同樣的訓練方式，說他能辨忠奸，將其牽上大殿，神鬣對著趙盾狂吠，趙盾說朝堂之大，容不下畜生，一語雙關，表面罵狗，實則罵屠岸賈非人。屠岸賈設計用一種毒蟲咬噬晉靈公，以此嫁禍趙盾，言其在酒中下毒毒死君主，並假傳晉靈公臨死前的旨意：殺趙盾，滅趙氏全族。神鬣撲上趙盾就咬，屠岸賈沒有給趙家半點喘息之機，按族譜滅了趙盾全族。
兩個作品相比，屠岸賈用狗攻擊趙盾和靈輒救趙盾的情節相同，元雜劇中當時趙盾逃脫，影片中趙盾當時被屠岸賈殺死。影片其它情節皆為激化矛盾衝突的加工，屠岸賈殺趙氏全族有其合理性和必然性。
（二）
元雜劇中，因趙朔的夫人是莊姬公主，屠岸賈不好直接殺趙朔，就詐傳晉靈公的旨意將其賜死。趙朔死後，莊姬被囚在府中，生下一個男孩。她以看病為名找來原是趙朔門客的草澤醫生程嬰，含淚請求他救孩子出去，到太平莊找趙朔的好友公孫杵臼，而此時屠岸賈在城門張掛榜文，凡是藏匿趙氏孤兒的，即誅滅九族。程嬰擔心屠岸賈拷問公主，公主只能在萬般不舍中自盡身亡。程嬰把趙氏孤兒放進藥箱，被屠岸賈的部下韓厥攔住，韓厥看透了屠岸賈的面目，深惡痛絕卻無力抗衡，他毅然決然放走了程嬰和趙氏孤兒，自刎以明志。
影片中，趙朔是當時被屠岸賈殺死的。屠岸賈喜歡莊姬，並沒想殺她，這種情愫元雜劇中沒有。程嬰的身份也是醫生，但原本和趙朔沒有關係。他情急中為莊姬接生，莊姬同樣懇求他救出孩子，去找公孫杵臼。韓厥奉命搜查，莊姬請求放過，假裝孩子還沒有出生，之後自盡身亡，韓厥因故意隱瞞實情被屠岸賈砍瞎了一隻眼睛。
兩個作品中莊姬自盡都出於母愛，影片中的情節更有感染力，只不過鏡頭的表現力尚不足，莊姬生產後一如常態也不甚合理，若是強撐虛弱的身體，盡全力保住孩子的性命，更能表現母性的堅強。韓厥沒有自刎，引發了之後的劇情，屠岸賈沒殺韓厥，讓其形象更為厚重，他狠絕殘暴但並不純粹，即使對背叛之人，也有手下留情的時候。
（三）
元雜劇中，屠岸賈追查不到趙氏孤兒的下落，宣布要把晉國一個月之上，半歲以內的嬰兒全部殺光。在這一關鍵時刻，程嬰獻出了自己未滿月的孩子，他找到了晉國的老宰輔公孫杵臼，公孫杵臼因朝政黑暗，不滿屠岸賈的專權，罷職歸農，不與奸佞共事。程嬰想把趙氏孤兒託付給他，把自己的孩子交出去，再背著藏匿的罪名赴死，而公孫杵臼要程嬰撫養孤兒，自己擔負罪名。
於是，程嬰和公孫杵臼上演了一齣戲。程嬰到屠岸賈面前告發了公孫杵臼藏匿趙氏孤兒，告發的理由也很充分，程嬰說為了挽救一國生靈，更是免我程家絕後。屠岸賈殺氣騰騰，直奔太平莊。公孫杵臼矢口否認藏匿孩子，得知是程嬰告發又開始大罵，他們這樣做是為了讓屠岸賈消除疑慮。狡猾的屠岸賈讓程嬰用大棍子打公孫杵臼，想看看二人的反應。程嬰完全沒有料到會有這一招，他推三阻四，打是打了，但是不太像，公孫杵臼也是語無倫次，險些暴露真相。這時，有人來報，在土洞中搜出了趙氏孤兒。屠岸賈大喜過望，馬上殘殺了這個假的趙氏孤兒，達到了他斬草除根的卑劣目的。
影片中，官兵搜捕時程嬰妻子抱的是趙氏孤兒，被當成程嬰的孩子抓走，而程嬰的孩子以趙氏孤兒的身份被中大夫公孫杵臼接走。在屠岸賈脅迫下程嬰說出趙氏孤兒的去向，程嬰的妻子和孩子藏在夾壁牆中，被屠岸賈搜出並殺害，公孫杵臼也因此殞命。
兩個作品中公孫杆臼儘管身份和死法略有區別，但人物形象是一致的，捨生取義、慷慨赴死。
元雜劇中程嬰忍辱負重、沉著堅毅，不僅僅是忠義，更是大愛，因為犧牲他的孩子，可拯救更多的無辜，英雄精神構成全劇的思想靈魂。影片中的程嬰是個沒有光環的普通人，他並不想自己的孩子替趙氏孤兒去死，招出公孫杵臼是因為他以為孩子已被送出城。但他是善良的，畢竟他救了趙氏孤兒，也救了全城嬰兒的性命，還獨自撫養孤兒長大。
程嬰妻子是影片中增加的形象，不僅表現母性，也為後面屠岸賈發現真相做鋪墊，同時因為妻子成了這場悲劇中的犧牲品，程嬰對屠岸賈的仇恨就變得更加複雜。
（四）
元雜劇和電影中此情節相同：屠岸賈覺得程嬰幫他完成了滅趙氏一族的計劃，就答應程嬰做了他的門客，趙氏孤兒名義上是程嬰的兒子，名叫程勃，被屠岸賈收為義子。
元雜劇中，趙氏孤兒長大成人，程嬰把真相告訴了他，趙氏孤兒悲憤不已，決意報仇。此時晉靈公已死，晉悼公在位，趙氏孤兒將屠岸賈專權橫行、殘害忠良之事稟明，在晉國國卿魏絳的鼎力相助下，屠岸賈被處以凌遲之刑。
影片中，屠岸賈和程勃是有父子情的，屠岸賈知道程勃就是趙氏孤兒時依然在戰場上救了他，他不是個十足的惡人，是個有血有肉的形象。程嬰的心態是複雜糾結的，他想讓程勃長大後殺了屠岸賈，可屠岸賈受傷時他還是拿出了救命丸。結尾在同一鏡頭中屠岸賈殺了程嬰，程勃殺了屠岸賈。
元雜劇中程嬰的復仇計劃是單純的，屠岸賈精心磨製了自己的斷頭刀，撫育了自己的掘墓人，是極大的諷刺。而影片中程嬰的復仇計劃是複雜的，屠岸賈更像個可憐人，自己對程勃付出了情感，而義子在得知真相後並沒有對他手下留情。這一結尾缺少必要的交代，情節顯得單薄而蒼白，是此影片的遺憾之處。
總體來說，元雜劇《趙氏孤兒》中，昏君奢靡無道，奸臣窮凶極惡，忠良慘遭屠戮，義士捨生取義，自始至終蕩滌著一股磅礴的沖天氣勢。影片《趙氏孤兒》中，程嬰的選擇更為當今觀眾接受，畢竟主動用自己的孩子替代別人的孩子去死，是有悖人倫的。
影片《趙氏孤兒》後半部分情節設置和細節雕琢上還有些欠缺，小到人物語言應有的時代特色（如「乾爹」應叫「義父」，「男人」應叫「夫君」），大到故事的流暢和主題的清晰，都需進一步完善。值得肯定的是其中的悲劇美感，畢竟這段故事是盪氣迴腸，給人以心靈衝擊的。
另附史料中此段故事的記載：
《左傳》里沒有屠岸賈，沒有程嬰，只是趙家的一場內鬥，趙氏一族互相誣陷殘殺，最後只剩下趙武，所以稱趙氏孤兒。
在《史記》中，《晉世家》和《趙世家》的記載也有出入，總結起來，和元雜劇的主要區別有五點。
第一，這段故事沒有趙盾，當時趙盾已經死了，是屠岸賈和趙朔之間的衝突；
第二，代替趙氏孤兒死的是別人的孩子，原文是「謀取他人嬰兒」，這一點不是義士所為；
第三，韓厥沒死，在屠岸賈將趙家滅門的時候稱病不出，後來他扶持趙武承襲了趙氏家族；
第四，程嬰和趙氏孤兒一直藏在山裡，沒有趙武認屠岸賈做義父的情節，屠岸賈被國君滅族；
第五，程嬰最後完成了報仇的任務，想去報與公孫杵臼知曉，拔劍自刎。