黃藥師很了不起，兩代華山五絕評選中，都有他名字。若把黃藥師放在一個班級里講，他絕對是班裡的優等生。按說，學習好的同學，基本上都會成為大家學習的榜樣，人們喜歡的對象，然而在眾金迷中，卻有很大一部分人不喜歡他。
黃藥師那麼優秀，為何還不討人喜歡呢？原因有三個。
第一，黃藥師性格古怪。
黃藥師性格有多怪，從他的名號就能反映出來。東西南北華山四絕，黃藥師占東位，名號中還帶了一個「邪」字。單看這一個字，你就知道黃藥師這個人，他不太好處。
《射鵰英雄傳》中，黃藥師收了六個徒弟。他和徒弟的關係，並不好。放現在而言，黃藥師絕對是那種不太受學生歡迎的老師。六個學生眼中的黃老師，看上去很嚴厲，整天板著一張臉，就好像人人欠他點什麼似的。所以，他的這六個弟子，都十分怕黃藥師，參照陳梅（陳玄風和梅超風）二人之戀，不敢跟師父說就可以看出來了。
用現下人們眼中對於性格古怪的人的定位說，黃藥師就是一個倔老頭，平時話少，還不愛笑。他給人以古怪的感覺，多半也是由此而來。
第二，黃藥師軟禁了周伯通。
周伯通好歹是王重陽的師弟，黃藥師從他手裡騙走半部九陰真經還不過癮，要打斷他腿，還將他關進山洞裡才甘心。做事情不給他人留餘地，這樣的角色，很難以討人喜歡。
黃藥師關了周伯通十五年，人生有多少個十五年呢？按照周伯通活到一百歲算，他人生中有將近六分之一的時間，是在桃花島上度過的。這十五年間，不僅黃藥師不去跟他說話，黃藥師還不准旁人跟他說話。沒人陪嘮嗑、不能上網、連張舊報紙都沒得看，黃藥師動輒還來給他吹一段碧海潮生曲。周伯通也正是在桃花島的這十五年時間裡，創出了左右互搏術這門了不起的功夫，可誰有懂自己跟自己打架的悽苦？
第三，對待黃蓉婚嫁的態度讓人難以接受。
黃藥師就一個女兒，親生的，然而他卻想要將這唯一的女兒，嫁給歐陽克。
我們再來一起認識一下歐陽克。
歐陽克，出場就三十多歲，那時候的黃蓉十六七歲。西毒歐陽鋒的侄子，實則是親兒子。歐陽鋒的兒子，與歐陽鋒一樣，也是個地道的反派，在江湖中名聲並不好。關鍵的一點，歐陽克妻妾成群。
黃藥師要將黃蓉嫁給這樣的一個人，有哪個讀者會接受？說白了他這麼做，直接得罪了相當一部分金庸迷的。
黃藥師第一次見郭靖，連正眼瞧一眼的時間都沒有；黃藥師聽聞歐陽鋒來桃花島提親，人還沒到，便喜不自勝。這一冷一熱的對比，讓人們感覺特別不好受。金迷們對黃藥師本人的好感度，也再次下跌。
口口聲聲愛女兒，結果卻要把黃蓉託付給那樣一個人，他到底是怎麼想的？假如馮蘅在世，她得知黃藥師要把黃蓉嫁給歐陽克這樣的人，她會作何感想？她會眼睜睜看著黃藥師將女兒往火坑裡推嗎？
以上三點，便是身為五絕高手的黃藥師，為何不討人喜歡的三個原因了。
當然，凡事都是對立的，黃藥師有不好的一面，也有他令人佩服的一面。其實他壞得並不算徹底，至少和歐陽鋒比較的時候，他要好得多。乃至《神鵰》中，金庸都在一度給他洗白，讓他往「俠」的方向，更加接近了。