同治十一年，兩宮皇太后幫助同治帝選妃，在幾位候選人中，同治需要確定一位為自己的皇后。當時慈安太后支持的是阿魯特氏，可慈禧太后支持的是富察氏。
阿魯特氏的父親崇綺是狀元，其生母是鄭親王端華次女。不過端華曾在辛酉政變中被賜死，所以阿魯特氏實際上也算罪人之後。按理來說，她的身份是不占優勢的，更不可能成為皇后。然而，阿魯特氏的外祖母，也就是鄭親王端華的嫡福晉，卻是慈安太后的親姑姑。也就是說，她是慈安太后的姑表外甥女，這就讓原本不具優勢的她，擁有極大的優勢。
而慈禧太后支持的富察氏出身名門，她之所以支持富察氏，也是看阿魯特氏是慈安太后的姑表外甥女，加上她自己與鄭親王一門交惡，因此她不可能支持阿魯特氏。
當然，這個選擇權最後還是交到同治本人手上。同治本來就和生母慈禧太后關係不好，他更是因此不喜歡富察氏。就這樣，阿魯特氏最終勝出，成為同治帝的皇后，即孝哲毅皇后。
然而，阿魯特氏剛進宮兩年，丈夫同治帝就因天花駕崩了。同治駕崩不久，年僅22歲的皇后阿魯特氏，也突然去世了。為何阿魯特氏去世如此突然，是否與慈禧太后有關呢？
關於阿魯特氏之死，一直有兩種說法：一是被慈禧太后所害；二是自盡而亡。
有人說，孝哲毅皇后之死，一定與慈禧太后有關。因為慈禧太后本來就不喜歡她，她入宮之後，與慈禧的婆媳關係很差。史料中記載阿魯特氏：「臥疾已久，今益劇矣。」就是說皇后曾經病重，慈禧還曾帶著光緒去探視過，因此有人猜測，慈禧或許在這次探病時「下了毒手」。
不過，這種說法明顯有些站不住腳，為什麼這樣說呢？
首先，慈禧帶著光緒去探望阿魯特氏，一個是太后，一個是皇帝，二人的行蹤肯定會被記錄下來，慈禧不太可能會下手。其次，當時慈安太后還在世，阿魯特氏是其姑表外甥女，慈禧顧忌二人關係，也不敢輕易下手。
而有的人說，是因為新帝即位的話，阿魯特氏就會升級為太后，這樣慈禧就沒有垂簾聽政的正當理由了。因此，慈禧才將阿魯特氏逼死。不過，首先慈禧要害阿魯特氏，慈安太后不會置若罔聞。另外，光緒繼承的是咸豐帝的皇位，所以慈禧名義上仍是太后，阿魯特氏只是皇嫂，根本不會影響她掌權。
還有種說法是，當時阿魯特氏懷有身孕，所以慈禧要害她。可阿魯特氏身為同治的皇后，如果有身孕的話，不可能沒有任何記載，因此這種說法也不可靠。也就是說，實則慈禧是沒有理由去害阿魯特氏的。那麼就還剩一種可能，阿魯特氏就是自盡的。那她為何要自盡呢？
其一，阿魯特氏身為同治的皇后，又與慈安太后有關係，她一定是不希望，慈禧將光緒接進宮的。只是同治沒有子嗣，出於當時的情況，她無法阻止慈禧這樣做。如此一來，阿魯特氏本來該是太后，卻變成了身份尷尬的皇嫂。她沒有子嗣，又無法插足政治，或許使她產生悲觀情緒。
其二，在當時的歷史環境下，是十分推崇「節婦」的。阿魯特氏的父親本就是狀元，飽讀詩書，所以對此自然更為推崇。受到家族影響，阿魯特氏很可能從小也推崇「節婦」，因此不是沒有殉死的可能。
（參考文獻《清史稿》《清實錄》《翁同龢日記》）