由於近年來假苗子事件多，不少菜農害了怕，為防止買到假苗子，他們專門從知名的大種子公司購買種子，自己育苗，不僅苗子不會假，而且節約成本。當前正是辣椒的育苗期，然而，不少菜農的育苗技術不過關，育苗過程中存在不少誤區，嚴重影響了辣椒苗的質量和成活率。
育苗前做好土壤處理，降低染病幾率
多數菜農育苗時並不使用穴盤，而是在棚中清理出一塊空地，採用平畦育苗，後期再進行分苗。經過一季蔬菜的生長，土壤中的病原菌及有毒物質不斷積累，再加上苗期根系弱，抗性差，苗子黃葉、染病的幾率大大增加。而且，很多菜農棚內的辣椒死棵嚴重，在不用藥劑處理土壤的情況下直接播種，很容易使苗子感染根部病害。
有條件的菜農可改平畦育苗為穴盤育苗，不僅能避免因重茬造成的危害，降低染病幾率，而且方便定植前藥劑蘸根防病。如果仍然採用平畦育苗，建議選用棚外大田地里的土壤做育苗土，同時使用藥劑如乙磷鋁、多菌靈等進行土壤消毒，預防土傳病害危害。
及時通風排濕
冬季育苗，面臨的一個問題就是苗子容易受凍害。為此，菜農多在大棚內加蓋小拱棚保溫，也有的採用雙層膜覆蓋。雖然保溫很重要，但是如果不通風排濕，苗床濕度過大，會誘發一些高濕病害的發生。因此，天氣晴好時一定要將小拱棚上的薄膜及時撤掉，並放風降濕。一般，在每天下午2點左右，適當放風換氣，可降低大棚內苗床的濕度。當發現幼苗的葉尖掛露時，說明苗床濕度過大，除堅持每天放風外，也可在苗床上適當撒施草木灰吸濕，能有效降低濕度。
適時補充微量元素
不少菜農反映，他們自己育的辣椒苗經常出現新葉發黃、小葉等現象，而根系生長正常。該問題的出現與缺素有很大關係，特別是缺乏鐵、硼、鋅等微量元素。由於採用平畦育苗，育苗畦是上茬蔬菜收穫後整理出來的一塊空地，菜農沒有在育苗畦內底施鐵、硼、鋅等微量元素的習慣，因此，很容易導致幼苗中微量元素缺乏，進而表現新葉發黃、捲曲、小葉等現象。如果發現幼苗出現新葉發黃的現象，可葉面噴施含鐵、硼、鋅等微量元素的葉面肥，促使幼苗儘快恢復生長。