只是可惜沒有多久波玄就因為突破輪迴境失敗被迫坐化了，臨終前他把黑暗祖符和黑暗聖鐮傳給了林青檀，還緊急宣布林青檀成為黑暗之殿新一任殿主。

不過黑暗之殿之中很多人卻是不服林青檀，為此還聯合起來針對林青檀，更是請出來黑暗之殿的兩位太上長老。還好林動及時趕到，擊敗這兩位太上老團，還幫林青檀收服了所有不服林青檀的人。

黑暗之殿也因此免於分裂得以一統，林青檀也因此成為黑暗之殿唯一的主人。黑暗之殿一統之後就好辦了，資源得以集中，可以完全供林青檀修煉之用，也因此林青檀修煉的速度更快了。

不過林青檀修煉的速度雖然快，但是異魔族入侵的步伐更快，最終人族頂級高手遠古六主也就是掌握六大祖符的高手聯手開啟了祖宮闕，讓人族年輕一代的高手都進入其中，也希望他們都能在短時間內大幅度提升修為。林青檀就進入了其中，等到從裡面出來後就突破到了輪迴境，這也就是武動乾坤中她達到的最高境界了。

因為沒有多久大結局之戰就爆發了，異魔族入侵，林青檀已沒有時間修煉，只能帶領黑暗之殿和東玄域的人一起對抗異魔族。

二，她最後又為何執意離開大陸

然後來說林青檀最後又為何執意離開大陸。在武動乾坤大結局之戰中，林青檀可以說出了大力，擊殺了不少異魔族的強者，更是見證了林動的崛起，還有林動是如何力挽狂瀾擊敗異魔皇拯救天下蒼生的。但是在這之後她卻執意要離開大陸，誰來也勸不住她。至於這是為什麼，只因為兩個原因。

第一個原因就是她已經知道了自己並不是林家人，是來自遙遠的大千世界。只是不知道怎麼回事，還是嬰兒的自己流落到了大陸，還被林家人收養，也因此成為了林家的一員。

如今她已經長大了，自然有權利也有義務找尋自己的身世，找到自己最開始的那個家。無論到時候找不找得到，還是找到了父母卻不認她，她都要去大千世界，也因此她就離開了大陸。

第二個原因就是林動要去大千世界找應歡歡出身的家族，好把應歡歡復活，林青檀不想和林動分開，便也執意要去大千世界。

何況大千世界未必安全，更可能沒有規矩只有叢林法則，到時候林動去了之後很可能遇到危險，林青檀就覺得萬一林動到時候遇到危險自己也可以助他一臂之力。最終林動說不過她，便同意她和自己一起去大千世界。也因此林青檀最終離開了大陸，去了大千世界，也就此和大陸的人分離。

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