公元前40億年，地球處於一個岩漿迸發的時代，地表根本沒有氧氣和水，這時地球處於「太古時代」，首批「泰坦巨獸」已經出現，他們依靠吞食核能和岩漿為生，逐步形成地球最原始的生命體。
公元前5.42億年，太古時代已經結束，寒武紀時代開啟，地球生命大爆發，各種普通動物誕生。公元前3億年，地球處於「石炭紀時期」，地表首批植物誕生，以及一些原始昆蟲誕生。
公元前2.5億年，地球處於深度輻射的時期，由於空氣中的氧氣濃度極高，導致陸地板塊的原始森林裡出現了很大巨型生物，從昆蟲到恐龍都是超大體型，此時「原子恐龍」已經誕生。不久之後，一個「死亡之群」被哥斯拉的原子吐息毀滅，與此同時，一顆小行星撞擊地球，當時撞擊造成的能量，基本上已經摧毀地球上的所有生命，只有泰坦巨獸和原子恐龍選擇進入休眠，才躲過了這次災難。
公元前1.3億年，白堊紀時代到來，板塊運動已經結束，亞歐大陸基本成型，地表只有史前巨型生物和恐龍存活，這是一個屬於恐龍統治的時代。
公元前6500萬年，一顆巨型彗星撞擊地球，造成恐龍大滅絕事件，同時期地球上75%的生命體死亡。公元前5萬年，亞特蘭蒂斯文明誕生，他們建立了宏偉而輝煌的宮殿，並將哥斯拉奉若神明，一直頂禮膜拜，還將他們與哥斯拉相處的圖案，雕刻在岩壁上，後來，由於地殼劇烈運動，導致亞特蘭蒂斯帝國永遠沉入海底。
公元前1.2萬年，魔斯拉從沉睡中甦醒，並成為了雲南人民的信仰圖騰，人們將魔斯拉供奉為自己的聖主，還將魔斯拉從幼蟲到蛹的變化過程，記錄在神廟的壁畫之中，說明當時的魔斯拉一定做過一些保護了人類的事情。
隨之，地球進入一個「諸神黃昏」的時代，外星生物「基多拉」闖入地球，他與地表原有的「毀滅者陣營」結盟，促使遠古大戰爆發。以哥斯拉為首，魔斯拉、初代拉頓、安吉拉斯形成軸心組織，一同開始抵抗「毀滅者陣營」，魔斯拉以犧牲自我的代價，與哥斯拉聯手將基多拉封印在南極。
沒過多久，哥斯拉家族和金剛一族爆發戰爭，那場上古戰爭十分慘烈，哥斯拉家族遭到金剛的重創，死傷無數，甚至連背鰭也被金剛一族拔出，並做成能量戰斧。因此，哥斯拉退守海底世界，開始沉睡和修養生息。而金剛一族由於缺少輻射能量，也逐漸開始退化，體型驟減到30米高的大小，他們再也無法統治地心世界，經常遭到骷顱爬蟲的群攻，最後金剛一族只倖存下最後一隻，退守在骷顱島。至此，哥斯拉和金剛兩族沒落。
公元前1100年，作為哥斯拉同族的「原子恐龍」，與至尊穆托發生了一場大戰，原子恐龍不幸戰敗，可是至尊穆托並沒有殺死它，而是在它的體內產卵，可是已經回到海底的原子恐龍，卻不幸感染而死。公元1000前年，古希臘將「泰坦巨獸」之間的戰爭，寫入了自己的神話中，其中對斯庫拉的記錄十分詳細。
地球紀元1915年，愛伊斯坦的「廣義相對論」，提出質能轉換的理論，這一理論也成為後來核聚變的基礎支撐。人類也徹底進入「原子時代」。1945年，廣島遭受一枚「小男孩」襲擊，爆炸產生的核輻射，驚動了沉睡在地下的泰坦巨獸，同時哥斯拉也已經甦醒，為了瓜分這些核能，哥斯拉與「死亡之群」大戰一場，並對廣島造成二次毀滅性打擊。
1946年，杜魯門秘密成立了「帝王組織」，這個組織主要以消滅太平洋的不明生物為主，後來卻演變成了「帝王計劃」，開始以尋找泰坦巨獸為目的。於是在官方的授權下，一支由世界各國精英組成的隊伍，開始尋找史前巨獸。
1953年，「菲律賓呂宋島」東海岸，哥斯拉成功用「原子吐息」擊敗了死亡之群，後者在軀體中分裂出一部分逃離了現場，前去尋找另一半死亡之群。剩餘組織被哥斯拉吞噬。帝王組織在菲律賓的監測站，搜集到了死亡之群的細胞，開始系統性地研究這些東西。1954年，人類首次確認哥斯拉的存在，並將帝王組織遍布全球各地。
1973年，人類衛星拍攝到了骷顱島的全貌，於是組織了一支小分隊，前往骷顱島探險。他們登島之後，便於惹怒了島上的金剛，結果遭到金剛的猛烈襲擊，最後無數人在戰鬥中慘烈犧牲。
隨後，人類設下陷阱，準備誘捕金剛，可是他們的詭計被金剛識破，同時這個陷阱也驚動了島上的骷顱爬蟲，結果骷顱爬蟲向小分隊發起猛烈攻擊，小分隊成員四散而逃，這時金剛挺身而出，擋住了骷顱爬蟲的去路，並與骷顱爬蟲大戰一場，將骷顱爬蟲擊殺，成功救下小分隊的女科學家，同時也捍衛了自己「島上之神」的地位。
2014年，一對穆托突然甦醒，並互相交配，產下數百枚卵。同時哥斯拉也已經甦醒，並加入到與雌雄穆托的決戰中，最後哥斯拉利用尾巴成功擊殺雄穆托，然後再將原子吐息，射入雌穆托的口中，徹底將其殺死，隨之，哥斯拉也退入水下。幾個月之後，哥斯拉再次與至尊穆托決戰，並成功消滅至尊穆托。
2016年，帝王組織在南極的冰原下發現神秘泰坦，這個泰坦巨獸一共有三隻頭，維維安博士在它周圍建立哨站，並開始研究它。帝王組織也給它命名為零號巨獸。
2019年，艾瑪博士成為了一名極端環保主義者，她認為人類是地球上的瘟疫，遲早會將地球毀滅。於是她秘密地喚醒史前的泰坦巨獸，企圖與巨獸一起共存於地球。隨著潘多拉魔盒的打開，基多拉、拉頓和魔斯拉一同甦醒，包括其他一些不知名巨獸，也一同橫空出世，開始摧毀人類的中心城市。
為了挽回這場災難，芹澤教授孤身一人下潛到海底，進入了亞特蘭蒂斯的宮殿，並釋放了一枚核彈，以來給哥斯拉補充能量，因此，也將哥斯拉引入了地表世界，哥斯拉為了保護人類世界，於是開始與基多拉決戰，在多次交手中，哥斯拉一直處於下風，甚至差點被基多拉擊殺，他最後在瀕死狀態下激活紅蓮模式，同時釋放出無窮無盡的能量，瞬間將基多拉秒殺。至此，哥斯拉再次成為地球王者，並接受了萬獸朝宗。
2021年，金剛已經從30米猛增到102米，體型與哥斯拉基本持平，他也回到地心世界取出能量戰斧，並在香港與哥斯拉展開決戰。兩人一共交手三個回合，第一回合金剛慘敗，第二回合，金剛扳回一局，可是最後一回合，金剛徹底被哥斯拉擊敗，甚至奄奄一息。
與此同時，人類利用基多拉的頭顱，製造出了機械哥斯拉，起初他們想用機械哥斯對付哥斯拉，可是機械哥斯拉後來失控，它的控制系統徹底被基多拉接管，又開始摧毀人類世界，這時哥斯拉挺身而出，攔住了機械哥斯拉的去路，可是他已經筋疲力盡，根本不是機械哥斯拉的對手，於是人類又喚醒昏迷的金剛，結果金剛與哥斯拉兩獸聯手，一起合力擊敗了機械哥斯拉。戰鬥結束之後，哥斯拉繼續退守海底世界，而金剛卻回到了地心世界。
2024年，長臂猿從沉睡中甦醒，屠殺了地心世界的所有巨獸，並再次一統地心世界，成為了新一代地球王者。