Haalthy導讀
靶向治療前需要進行基因檢測,查找突變的基因,從而選擇合適的藥物。但是在基因檢測報告上,不僅僅有基因突變的類型,還有一項重要的參考項目:突變丰度。
基因突變丰度是什麼呢?丰度值的高低有統一標準嗎?丰度值高好還是低好呢?想知道這些問題,一起看下今天的文章吧。
基因突變丰度是什麼?
拿到一份基因檢測的報告,我們常常可以看到一項參考數值:丰度,這個數據令很多病友不解,「丰度」究竟是什麼呢?以肺癌中最常見的EGFR突變為例:
「丰度」可以簡要理解為EGFR突變頻率占總的DNA中的濃度,也有學者將丰度定義為EGFR突變和野生型拷貝的比值,目前沒有明確的定義。
為什麼不同的患者突變丰度不同?
不同的患者基因檢測的突變丰度會有很大的差異,這種差異主要與腫瘤異質性相關,過去我們認為同一個體中腫瘤細胞是相同的,基因相同、空間結構也相同;然而,隨著檢測技術逐漸精準化,我們才發現同一份樣本組織中,腫瘤細胞的基因、蛋白等各個結構並不一致。
這種特徵更通俗而言,可以用一句古語表達「一母生九子,九子各不同」,原來定居的腫瘤細胞不斷演變出不同的後代。同一部位腫瘤會產生不同的基因表達,不同部位的腫瘤表達又有可能出現新的改變,不同人之間又會有區別,從宏觀上看是人和人不同,微觀上看腫瘤和腫瘤也不同。
也就造成了不同的患者即使具有相同的基因突變,彼此之間突變的丰度也會有所不同,進而表現為對於同一種藥物的反應也不同。
高、低丰度判斷標準
早期,丰度高低的定義與基因檢測方法敏感性有關,如直接測序法需要EGFR突變頻率達到20%-30%才能發現,而ARMS檢測只需要EGFR突變頻率達到1%即可檢測到。只要檢測到突變即為高丰度。但這種定義過於籠統化,不具有區分性。
但目前對於基因檢測的丰度高低值判斷仍舊沒有統一的區間標準。不同的測序方法、不同的檢測公司會有不同的數值設定。
基因突變丰度高可能提示TKI治療效果好
有中國學者發現EGFR突變丰度可以預測EGFR- TKI治療晚期非小細胞肺癌的療效。研究選取了100個樣本,其中有51例EGFR突變患者丰度較高,18例EGFR突變患者丰度較低,31例患者攜帶野生型EGFR。
將這100例患者同時進行直接DNA測序和ARMS檢測,
兩種方法檢測均為陽性則為EGFR突變高丰度;
ARMS檢測陽性、直接DNA測序為陰性則為低丰度;
二者均為陰性則為攜帶野生型EGFR。
所有患者均接受吉非替尼治療,檢測標本腫瘤細胞超過50%。分析了EGFR突變丰度與吉非替尼治療臨床療效的關係結果如圖所示:
圖一:EGFR突變丰度高、EGFR突變丰度低和EGFR野生型三者比較
中位無進展生存期(mPFS)
11.3個月 vs 6.9個月 vs 2.1個月;
客觀緩解率(ORR)
62.7% vs 44.4% vs 16.1%;
總生存期(OS)
15.9 個月 vs 10.9個月 vs 8.7個月
由此得出,基線相對EGFR突變丰度可以預測TKI 獲益程度。突變丰度越高,也就越有可能獲益。
對於該研究的三個延展性問題
結果有差異
由於腫瘤異質性、基因檢測的方法、獲取的標本、研究者關於丰度的定義等因素並不統一,因此不同試驗會得出不同的結論。
如,有研究者用同樣的方法,結果發現高低丰度患者對TKI反應沒有顯著不同,直接測序和ARMS法檢測突變結果不同的患者和相同的患者,PFS分別是13.4和10.9個月,沒有顯著統計學差異,可能與該試驗的標本選擇有關。
總之,EGFR基因突變丰度高可能提示EGFR-TKI治療效果好,但二者之間不存在必然關係。
丰度動態變化也可以反應TKI治療效果
有研究顯示:血漿中EGFR突變快速降低可能預示更好的TKI反應。FASTACT-2研究顯示第3周期時血漿EGFR突變依舊陽性可能預示較差的臨床結局。
其他基因突變丰度是否具有相同的結論
目前,沒有資料顯示其他基因突變丰度對於靶向治療效果的研究,因此,能否將同樣的結論類比到其他的基因突變丰度,尚待考量。
以上是肺騰助手為病友們整理的基因檢測突變丰度的小知識,希望對大家有幫助!
參考資料:
[1].https://ascopubs.org/doi/pdfdirect/10.1200/JCO.2010.33.3757
[2].邵宜,鍾殿勝 .EGFR突變丰度的檢測及其臨床意義[J].中國肺癌雜誌,2017,20(8):578-582