小细胞肺癌(SCLC)是最致命的肺癌类型,精准用药方案较少。最近,一项研究分析了33例广泛期SCLC患者的循环肿瘤DNA(ctDNA),发现ctDNA水平和动态变化特征与临床反应和生存结果密切相关。
Sivapalan等人研究了广泛期小细胞肺癌(ES-SCLC)患者循环肿瘤DNA(ctDNA)动力学与临床反应和生存结果的相关性。该研究使用TEC-seq对33例ES-SCLC患者进行了血浆游离DNA(cfDNA)杂交捕获NGS测序,其中32例患者也进行了匹配外周血单个核细胞(PBMC)测序。将血浆与匹配的PBMC测序结果进行比较,过滤掉胚系突变和克隆性造血相关突变,得到肿瘤特异性单核苷酸变异(SNV)和插入/缺失(indel)。此外,使用CNVkit对血浆进行了全基因组拷贝数变异(CNA)分析。
作者假设,靶向SNV / indel和全基因组CNA数据的结合,称之为游离肿瘤负荷(cfTL),将提高检测ctDNA分子反应的灵敏度。对每位患者至少三个时间点(治疗前,治疗期间和临床进展时)的血浆样本进行纵向分析。然后,将ctDNA动力学分为三组:分子缓解(cfTL持续完全消除),分子缓解后复发(cfTL最初消除,最终时间点升高)和分子进展(cfTL所有时间点持续存在)。中位随访时间11个月,发现cfTL动力学与无进展生存期(PFS)、总生存期(OS)、持久临床获益和先于影像学结果相关,提示cfTL作为动态的液体活检生物标志物可能具有价值,或可比标准影像学更早捕获分子反应。
作者还强调了匹配PBMC DNA测序的重要性,该方法可以提高ctDNA分析的特异性,不需要配对肿瘤组织测序。在该研究队列中,35%的患者TEC-seq检出PBMC来源的突变,如果未进行匹配PBMC测序,这些突变可能被错误地归类为肿瘤来源。当这些PBMC来源的突变未被过滤掉时,ctDNA分析不能有效地对生存结果进行分层,类似于先前研究在胃癌患者中观察到的情况。因此,通过对匹配的PBMC进行深度测序,从ctDNA结果中过滤掉这些克隆性造血相关突变非常重要,可以最大程度地减少假阳性结果,最大限度地提高预后评估能力。
2017年,我们发表了一项研究,主要关于非小细胞肺癌,但包括3例局限期SCLC患者,其中2例SCLC患者在根治性放化疗后ctDNA可检出,预测疾病进展。剩下1例SCLC患者ctDNA治疗前可检出,治疗后立即转为不可检出,预测长期无病生存。2018年,Almodovar等人发表了SCLC患者临床梗概,提示ctDNA变化可以先于临床进展,判断影像学混合反应,能够早期识别对治疗不敏感,以及提示疾病缓解。最近,Nong等人以及Herbreteau等人表明,治疗前ctDNA水平较高(高于队列中位水平)的SCLC患者PFS和OS比ctDNA水平较低的患者差。
与Sivapala等人的研究一样,这些先前的研究使用靶向杂交捕获panel检测cfDNA SNV和插入缺失。Sivapala等人研究的一项创新是其纳入了全基因组CNA状态,这使得6例血浆未发现肿瘤特异性突变的患者能够进行分子反应评估。此外,与之前的四项研究类似,Sivapalan等人的研究采用了肿瘤不知情的ctDNA分析方法,这使得使用该技术的前瞻性研究在SCLC患者中更加可行。
与先前的研究相比,Sivapala等人的研究还有一个独特之处,添加了第三个ctDNA反应类别——最初缓解随后复发,这只能通过多个时间点连续分析ctDNA来实现。有趣的是,属于这种中间反应类别的患者生存结果也中等,介于分子缓解患者和分子进展患者之间。未来,不仅在SCLC中,而且在其他实体瘤类型中,证实这些发现将是有趣的。未来的临床试验应确定是否可为这些患者进一步定制治疗,如果成功,这将是一个重大的临床贡献。
尽管该研究的结果很有希望,但要注意,一些问题仍未得到解答,包括ctDNA分析时间点未标准化,不同患者间不匹配,或与影像学时间点不匹配,以及使用TEC-seq方法鉴定的RB1突变率异常低。据报道,在所有SCLC患者中,RB1突变率为65%-90%,但该血浆cfDNA检测队列的RB1突变率仅为15%。作者指出,这可能与探针覆盖不全有关,靶向杂交捕获探针仅覆盖了RB1基因31%的编码序列。优化panel很重要,以便在临床应用之前,更好地捕获SCLC的典型基因组特征,包括RB1突变的高发生率。
假设panel可以进一步优化,需要考虑如何将这种cfDNA技术与临床实践相结合。作者认为ctDNA监测可以提供及时干预的机会,但是,这些信息真的能帮助我们做出临床决策吗?需要注意的是,目前ES-SCLC治疗方案有限,在影像学进展之前了解患者是否对标准治疗有反应,不一定会改变治疗决策。因此,进行后续研究,确定ctDNA是否具有预测性,是否可以为个体化治疗决策提供信息,以改善这种致命疾病的生存结果非常重要。
总体而言,Sivapala等人的研究为ES-SCLC的ctDNA监测提供了有价值的数据,在这之前的研究不包括全基因组CNA分析。然而,尽管引人注目,但鉴于该研究或该领域既往研究缺乏预测数据,没有关于临床上如何利用ctDNA数据的明确指导,我们认为ctDNA在SCLC中的应用还未准备好进入黄金时代。不过,我们同意作者的观点,ctDNA在SCLC中具有巨大的潜力,该研究为未来临床试验铺平了道路,可以探索基于ctDNA的分子进展能否促使治疗升级或调整,基于ctDNA的分子缓解能否促使治疗中断,以及对选定患者的密切监测(图1)。未来的研究应该将ctDNA指导的治疗与标准治疗进行比较,如果成功,可能会改变这种致命疾病的临床管理和生存结局。
图1. EC-SCLC使用ctDNA指导个体化治疗决策的临床试验设计建议
参考文献:
Pellini B, Chaudhuri AA. ctDNA Monitoring for Small Cell Lung Cancer: Ready for Prime Time? Clin Cancer Res. 2023 Jun 13;29(12):2176-2178. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-23-0420. PMID: 37097069.