文 | 冯唯唯
2月3日,《自然》杂志在线发表了来自中国学者的两篇关于新冠状病毒(2019-nCov)的研究结果。
新型冠状病毒分析
在其中一篇研究论文中,中科院武汉病毒所研究员石正丽及同事对引发呼吸系统疾病的2019-nCov进行了鉴定和表征,揭示了其与严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒的相似性。
这篇文章发现了新型冠状病毒来源于蝙蝠的证据,但是此次爆发的动物来源尚待确认。
冠状病毒一直是人类传染病流行的一个来源,如SARS和中东呼吸综合征(MERS)都是由冠状病毒引起的。SARS相关的冠状病毒主要是在蝙蝠等哺乳动物体内被发现的,对公共健康构成了潜在威胁。
据报道,此次疫情或在2019年起源于武汉市一海鲜市场。
患者症状包括发烧、气促和肺炎。此后疫情已蔓延至中国其他地区及海外。
截至发稿时,目前已发现超过17000例病例,死亡人数超过300人。
石正丽及同事分析了7例重症肺炎患者的样本,其中6人为武汉海鲜市场内的工人,该海鲜市场在2019年12月首次发现病例。
研究者发现在其中5名病人身上获取的全长度基因组序列彼此之间几乎完全一致(相似度超过99.9%),与SARS冠状病毒有79.5%的序列一致。
此外,研究人员发现,该病毒序列与一种蝙蝠冠状病毒在全基因组水平上相似度高达96%,表明蝙蝠可能是该冠状病毒的来源。
研究人员发现七个被鉴定和测序出的非结构性蛋白也存在于SARS冠状病毒中,表明该病毒是一种与SARS相关的冠状病毒,作者暂时将其命名为新型冠状病毒(或2019-nCoV)。
他们确认了2019-nCoV进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,即通过ACE2细胞受体。
从感染2019-nCoV的病人体内分理出的抗体显示出在低血清稀释度下中和病毒的潜力,但是抗SARS病毒抗体是否能与2019-CoV交叉反应,仍需用从SARS病毒感染中痊愈的病人的血清来确认。
作者开发出了一种可以将2019-nCoV与其他所有人类冠状病毒区分开的测试,并展示在最初的口腔拭子样本中检测到了2019-nCoV,但随后(大约十天后)采集的样本没有显示阳性病毒结果。
这项发现表明,最有可能的病毒传播途径是通过个体的呼吸道,不过作者也指出其他途径亦不无可能,仍需更多患者数据来进一步研究传播途径。
此前,相关成果于1月23日发表于生物预印文本库BioRxiv
(https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v2)。
《自然》论文链接:
https://nature.com/articles/s41586-020-2012-7
新型冠状病毒的基因组序列
另一篇《自然》论文则介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。
该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。
基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。
最近出现在武汉的一种2019-nCov已传播到中国其他地区和其他几个国家,其中包括美国、德国和日本。
首例患者于2019年12月12日被收治入院,调查发现武汉一家同时销售野生动物的海鲜市场或是此次疫情的潜在来源。
张永振等研究了一名41岁的男性海鲜市场工人,其于2019年12月26日在武汉一家医院住院,表现出呼吸系统疾病症状,包括发烧、胸闷和咳嗽。
联合使用抗生素、抗病毒药和糖皮质激素进行治疗,但患者表现出呼吸衰竭,治疗三天后病情无改善。
作者对从患者收集的支气管肺泡灌洗液(肺分泌物)进行了基因组测序。
他们鉴定出了一种新型病毒,并发现该病毒基因组与蝙蝠体内发现的SARS样冠状病毒有89.1%的核苷酸相似性。
作者表示,尽管从单个患者的分析中不可能得出该冠状病毒是当前疫情爆发原因的结论,不过这些发现已被针对其他患者的独立调查研究证实。
相关序列信息1月10日发表于病毒学网站(http://virological.org/t/novel-2019-coronavirus-genome/319)。
《自然》论文链接:
https://nature.com/articles/s41586-020-2008-3
另,2月3日,施普林格·自然(SpringerNature)集团设立了冠状病毒文章资源网页。
施普林格·自然从旗下期刊中整理了最新发表的与冠状病毒研究最相关的论文,并与相关评论文章和书籍一起汇总于这个专题网页。
该网页将持续更新,其中的所有内容可免费获取。
当天,施普林格·自然还签署了名为“分享与新型冠状病毒(nCoV)爆发相关的研究数据和成果”的共识声明,使读者能够快速、直接获取最新的现有研究、证据和数据,来支持全球应对日益爆发的新冠状病毒疫情。
施普林格·自然相关冠状病毒文章资源网页:
https://www.springernature.com/gp/researchers/campaigns/coronavirus