湿疣疱疹反复发作久治不愈的四大根源：
1）病毒结构特殊，不易彻底清除：由于HPV/HSV病毒结构的特殊性，药物难以进入，主要是因为病毒是由核心DNA和蛋白质衣壳组织构成，并且病毒衣壳外还被一层含蛋白质或糖蛋白的类脂双层的被膜包裹。由于衣壳与类脂双层被膜的致密坚韧，特殊结构形成了一道药物难以进入病毒核心DNA的多重屏障，导致病毒不容易杀死，尤其是病毒入侵到人体正常细胞核内，再次增加一层细胞膜包裹，导致病毒更加难彻底杀灭。
2）患者自身免疫力低下：有部分HPV/HSV病毒隐藏在患者的神经节或细胞核内。当患者自身免疫力下降时，比如：生病、酗酒、过度劳累的时候，潜伏的病毒就是会重新复活，然后开始繁殖，复制出大量的病毒，随之又沿神经轴返回皮肤黏膜，病灶逐渐扩大，从而出现湿疣疱疹复发。
3）没有进行专业规范的治疗：没有进行科学有效的诊断和治疗，造成病情误诊、漏诊、误治、失治及忽视合并症的治疗，以及在治疗过程中存在着侥幸心理，没有遵循医生的叮嘱按疗程服药，或者是自己乱买药、乱用药，从而导致自身出现耐药性以及副作用。
4）夫妻没有同诊同冶：许多患者对性伴侣隐瞒病史，特别是夫妻之间，继续过性生活，继而再次传染给对方，造成反复交叉感染。还有一些患者控制力差，治愈后还与多人发生性行为，而这些人当中有人患有湿疣或疱疹，就极有可能会再次感染疾病，引起复发。
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