GraphPad Prism 9是优秀的统计分析软件,其强大的统计绘图功能可以快速直观的给出统计的结果,节省时间,提高工作效率,Prism项目文件不仅包含数据、分析和图形。Prism文件可以是您实验的完整记录。每个文件可以包含任意数量的数据表、信息页面、分析结果、图表和页面布局。
GraphPad Prism 9激活版出自:https://www.macz.com/mac/472.html?id=NzY4OTU4Jl8mMjcuMTg3LjIyNy40Mw%3D%3D
一、示例数据
虽然这个和软件功能没有什么太大的关系,但是还是不得不提这个人性化的版块。
此次更新最惊喜的还是打开界面后,虽然和之前的版本没有太大出入,但是,每种类型 Graph 下,都有 tutorial data set,就是演示数据集。
如果你要做某一类数据画图,可以先用演示数据集看看数据结构和操作,这对于学习软件有很大的帮助,上手更快!
二、自动添加差异分析显著性结果
以前我们常规的操作是输入数据,分析结果,画图,然后在图上画线,标记 * 号或者 p 值来表示数据之间的显著性,就需要不停的画线,以及在统计结果页面与画图页面不断切换,非常不方便。
那时,多么想要一个自动化的功能啊,Graphpad Prism9“人性化”地解决了这个问题。
接下来,以一组数据画柱状图为例展示这个功能。
首先建立 [data table],我们选在 [group],输入数据,方法和之前版本一样!
点击菜单栏 [Analysis-Analyze] ,选择 [One way ANOVA] 进行统计学分析,接着点击 [new graph] ,选择需要呈现的图形画图,如下图。
点击 [菜单栏-Draw] 的黑色星号,然后点击图形需要添加的位置,就直接添加了。
而且线段的长短都是按照图形间距自动设置的,不同手动去画,星号数目、形式等都可以自己选择,不用手动输入了。
然而,这个操作还不是太自动化,想要一键显示所有显著结果(一劳永逸),点击 [菜单栏-Draw] 下红色星号就可以实现了。
它会根据之前的分析结果,将每个组之间的比较结果添加到图形上。
可是这个图并不怎么好看,需要自己细微的调整,那么就双击图上添加的星号,在弹出来的对话框中调整添加线的颜色,粗细等等,还可以选择显示 p 值。
如果要选择性的展示自己需要观察的组织间的对比,其他的显著性不想展示,则可以点击 [Comparisons on graph] ,取消勾选不想显示的比较的组,则可以去掉。
三、气泡图
很多人可能会问了,气泡图有什么好说的,确实没什么好说的,但是架不住它好看啊,主要在于怎么去用,用的对则会发挥更好的效果。
这里我们要提到的是 GO 或者 KEGG 富集分析结果的可视化,最常见的是柱状图形式的,可能大家都看腻了,高分文章则在不断创新(秀技能),呈现出好看的结果。
接下来,我们也试一次。
首先,准备一个 GO 或者 KEGG 分析的结果文档!
选择 Prism9 中 [Multiple variables] ,导入数据。
点击 [creat new graph] ,选择气泡图,按自己要求设置坐标轴,这里我们将-LOG10(P)设置为 x 轴,Count 设置为纵轴,用 Count 反映泡泡大小,GO term 用不同的颜色显示,点击确定。
生成的图形如下:
如果要调整图形,双击图片或者圆圈,可以变换坐标轴,圈圈的颜色、大小等等参数,总之达到目的就可!