雙旗幣的價值不高主要有以下幾個原因：存世量大：雙旗幣是民國時期的一種貨幣，為了儘快消除民間貨幣混亂對經濟造成的影響，力求代替清政府所使用的銅元，所以發行量非常大，因此，在收藏市場上，雙旗幣銅幣非常常見，品相好的也不多，大部分的收藏價值確實不高。收藏門檻低：雙旗幣有銀的和銅的兩種版本，經常可以接觸到，對於普通收藏者來說，這種錢幣並不珍貴。
替代性強：雙旗幣作為民國時期的貨幣，有很多省份都發行過，而且鑄造數量有多有少。對於一些省份鑄造數量比較少的雙旗幣，其收藏價值會相對較大一些，但對於大部分省份鑄造的雙旗幣來說，由於其收藏價值低，往往被收藏者所忽視。市場炒作不足：雙旗幣雖然有一定的收藏價值，但是市場炒作不足，沒有太多的資金進入這個領域，因此其價值一直不高。總之，雙旗幣雖然具有一定的收藏價值，但是因為存世量大、收藏門檻低、替代性強和市場炒作不足等原因，其價值一直不高。雙旗幣作為一種歷史文物，其價值主要由稀有程度、存世量、品相、精美度和版本等多個因素組成。
一些特殊版本的雙旗幣，如湖南省雙旗幣、河南省雙旗幣等，由於其稀有性和歷史意義，價值相對較高。品相是指古錢本身的鏽蝕程度及錢文、輪廓的清晰程度。一枚保存完好、品相優秀的雙旗幣往往能拍出高價。雙旗幣的精美度對其價值也有很大的影響。一些設計獨特、鑄造精美的雙旗幣，如王莽政權時期的錢幣，因其外形及幣面上的書法藝術達到了非常完美的程度，即使其存世量較多，但市場價格依然較高。
不同版本的雙旗幣在鑄造數量、設計風格、文字表達等方面都有所不同，因此具有不同的收藏價值和市場價格。需要注意的是，古錢幣市場的價格波動較大，且價值往往受到市場供求關係的影響。因此，對於雙旗幣的具體價值評估，需要根據其稀有程度、品相、歷史背景、存世量等多方面因素綜合評估。