12月25日,中國科學院生物物理研究所生物大分子國家重點實驗室李國紅課題組與感染與免疫重點實驗室朱明昭課題組合作,在《自然》(Nature)上發表了題為H2A.Z facilitates licensing and activation of early replication origins 的論文。該研究發現組蛋白變體H2A.Z能夠通過H2A.Z-SUV420H1-H4K20me2-ORC1通路幫助在染色質進行複製起始位點的選擇,並進一步發現受H2A.Z調控的複製位點相比於其他的複製位點有著更高的複製信號,也更偏向在複製期早期被激活使用。
DNA複製是一個確保遺傳信息精確傳遞的生命過程。細胞在G1期時,複製起始識別復合物(Origin Recognition Complex, ORC)識別染色質上的複製位點,進一步招募DNA解旋酶MCM等,形成複製前體復合物(pre-Replication Complex),完成複製起始位點的認證。而當細胞進入複製期S期時,被認證的複製起始位點被選擇性地激活使用。在真核生物中,複雜的染色質結構上存在多個複製起始位點。真核生物DNA複製起始位點的選擇受DNA序列和表觀遺傳因素共同調控。目前,表觀遺傳因素對染色質上DNA複製起始位點的選擇機制仍然很不清楚。
李國紅課題組結合生物化學和細胞生物學實驗發現,含有組蛋白變體H2A.Z的核小體能夠通過直接結合甲基化酶SUV420H1,促進核小體上的H4組蛋白第20位賴氨酸發生二甲基化修飾(H4K20me2)。而帶有H4K20me2修飾的H2A.Z核小體,能夠招募複製前體復合物中的ORC1(Origin Recognition protein 1)蛋白,從而幫助染色質上複製起始位點的選擇。通過全基因組學分析,該課題發現在HeLa細胞中,H2A.Z與H4K20me2、ORC1以及被激活使用的複製起始位點在全基因組上有非常高比例的共定位。而當在HeLa細胞中敲低H2A.Z時,H4K20me2、ORC1以及複製信號都有大幅降低。進一步的研究發現,受H2A.Z調控的複製起始位點比其他的複製起始位點有更高的複製信號,並偏向在複製期早期被激活使用。
為了研究這個通路在生理條件下的作用,李國紅課題組與朱明昭課題組合作,構建了在小鼠T細胞中條件性敲除H2A.Z的小鼠。研究結果也發現,在T細胞中條件性敲除H2A.Z會導致活化後的T細胞增殖變慢,複製信號顯著降低。
該工作的通訊作者為朱明昭和李國紅。李國紅課題組的龍海珍、張力圩、溫增麒,以及朱明昭課題組的呂夢婕為論文的共同第一作者。朱明昭課題組的金彩薇、生物物理所質譜平台楊福全課題組的陳秀蘭、清華大學鄧海騰課題組的張文浩、北京大學裴劍鋒課題組的李佟清對該工作也有重要貢獻。該課題獲得國家自然科學基金、國家重點研發計劃項目、中科院先導項目以及中科院前沿科學重點研究計劃的資助。
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5、據說,這是生物醫學碩士博士生的真實的生活寫照