印尼在二戰後，擺脫了殖民統治，走上了獨立的道路。可印尼和印度有點像，看來真是物以類聚，印尼死活想要繼承荷蘭在東南亞的全部殖民地，並且對周邊一些小島更是充滿了吞併的慾望。就這樣，印尼建國沒幾年就吞併了西巴布亞。緊接著，又吞併了更弱小的東帝汶。
按道理，兩起事件也就差了十來年，況且東帝汶面積小，人口少，跟西巴布亞根本不是一個級別。可為什麼反而是東帝汶獨立呢？
印尼早在獨立前，其實就已經開始考慮建國後的疆域問題。特別是蘇加諾確實考慮有點長遠。蘇加諾就認為印尼責無旁貸是荷蘭殖民帝國的繼承人，而所屬荷蘭的紐幾內亞西部理所當然的屬於印尼。
果不其然，印尼獨立後，開始考慮紐幾內亞的前途問題。荷蘭是堅決反對的，荷蘭認為這裡跟印尼人種不同，民族不同，西巴布亞又從東印度分離出來，理應獨立。而西巴布亞也正是在荷蘭支持下，積極地籌備獨立，甚至把國旗和國歌都已經選定。
而澳大利亞此時正占據島嶼的東半部分，非常擔心印尼在得到西巴布亞後對自己的託管地提出領土要求，況且紐幾內亞島距離澳大利亞有點近，澳大利亞非常擔心北邊的防務問題會加劇，所以和荷蘭組成了統一戰線。
英美兩國還是挺支持印尼的，這主要是因為處於冷戰時期，美國擔心印尼向蘇聯靠攏。在美國施壓下，荷蘭和澳大利亞只好選擇接受。但荷蘭確實力不從心，又鞭長莫及。畢竟荷蘭不可能為了西巴布亞而得罪英美等國，況且荷蘭國內老百姓對政府出錢出力，不是太滿意。澳大利亞更是英美的小弟，更不會為一點小事討嫌。
但荷蘭還是不死心，要求將巴布亞地區交由聯合國監管，並且讓巴布亞人民自主決定未來，巴布亞地區於1969年在舉行全民公投，公投結果是大多數巴布亞人民同意加入印尼，不過，這一結果並不被部分巴布亞獨立人士認可。這一點印尼倒是和當年印度吞併錫金類似，都採取了暴力加「光明正大」的公投。
東帝汶儘管只是彈丸之地，自身實力不足，但還是和西巴布亞有很大區別。
西巴布亞本身就是荷蘭殖民地，和荷屬東印度也有著說不清的關係，所以很多國家不太願意多表態，現在仍然被印尼占領的西帝汶恰恰也是荷蘭殖民地，但東帝汶並不是，而是葡萄牙殖民地。所以說東帝汶跟印尼沒有半毛錢關係，這讓印尼根本沒有任何理由吞併東帝汶。
而吞併東帝汶的行為完完全全是一個公然挑戰二戰後的國際秩序，根本不可能得到聯合國支持。況且葡萄牙始終堅決反對印尼的侵略行徑，在國際上頻頻發聲。還有包括中國在內的多個國家也反對印尼吞併東帝汶，聯合國更是三番五次的制裁，這讓印尼很被動，再加上印尼經濟陷入困境，最終選擇放棄東帝汶。